Универсальный строительный материал (любая климатическая зона). Используется для внутренних и наружных работ. Изготовлен из древесной стружки, портландцемента и минерализующих добавок.
При производстве используется следующая технология: измельченная до длины 6-9 см щепа хвойных деревьев располагается в разном направлении: сверху и снизу – вдоль, а в середине – поперек.
Применение:
Для внутренней и наружной отделки стен при возведении каркасных конструкций.
В качестве несъемной опалубки, чаще всего, для мелкозаглубленных ленточных фундаментов.
Обустройство вентилируемых фасадов.
При устройстве обрешетки сплошного типа.
Как основа для укладки напольного покрытия.
Из них делают некоторые элементы конструкции (например, подоконники, различные козырьки).
В производстве сэндвич-панелей.
При возведении построек из древесины. ЦСП надежно ее защищают от негативного воздействия внешних факторов.
Обустройство дорожек, ограждений и многого другого.
Преимущества:
Высокая прочность, устойчивость к влажности и долговечность.
Превосходная тепло- и звукоизоляция.
Простота в обработке и применении.
Стойкость к появлению плесени и грибковых образований.
Возможность применения любого вида отделки: лакокрасочных составов, штукатурки, облицовки из керамики или пластика.
Пожаробезопасность обеспечивается за счет входящего в состав цемента.
Плита не растрескивается от низких или высоких температур благодаря древесной стружке.
Не повреждается насекомыми и грызунами.
В составе плит отсутствуют вредные примеси в виде асбеста или формальдегида.
Для получения консультации, возможных скидках и способах доставки свяжитесь с нашими специалистами по телефону или положите товар в корзину, оформите заказ и мы с вами сами свяжемся и максимально быстро и результативно решим ваш вопрос!
Сортировать по:
Высочайшее качество нашей продукции — это наше и Ваше преимущество. Широкий ассортимент дает возможность оптимального выбора необходимых Вам товаров, по приемлемой цене. Вы можете оформить заказ по телефону и рассчитаться при получении.
Цементно-стружечные плиты, применение в строительстве.
ЦСП – это цементно-стружечные плиты, сравнительно новый комбинированный материал для строительства и сухой отделки.
Производство
Плиты ЦСП производят из древесины твердых пород, чтобы обеспечивать высокую прочность изделий. Перед измельчением породы тщательно высушивают до нормального рабочего состояния (до 10-12%).
В состав ЦСП входят:
Стружка – 24%;
Портландцемент – 65%;
Вода – 8,5%;
Гидратационные добавки – 2,5%.
В емкостях происходит смешивание компонентов, затем масса попадает в установку, где из раствора формуются плиты под прессом. На выходе получается гладкое изделие.
Процесс формования проходит таким образом, что внутри плиты оказываются крупные стружки, а у поверхностей – мелкие. Таким образом обеспечивается высокий уровень прочности изделия.
Разновидности плит
Что такое цементно-стружечная плита – это комбинация цемента с добавками и древесной стружки. Её размер и свойства определяют несколько видов плитных изделий:
Арболит – изделие из мелкой стружки и опилок. Обладает высокой пористостью, как следствие – хорошими теплоизоляционными и звукопоглощающими свойствами. Из него делают перегородки, используют как самостоятельный отделочный материал;
Фибролит изготавливают из длинных древесных волокон. Такие изделия хорошо работают на изгиб. Их легкость, гибкость и пористость позволяют использовать в качестве эффективного утеплителя.
Ксилолит имеет в составе стружку разной фракции и специальные добавки – каустический магнезит, хлористый магний. Это прочные плиты, служат в качестве напольного покрытия (сухая стяжка).
Цементно-стружечная плита: технические характеристики
Любой профессионал, выбирая строительный материал для тех или иных целей, опирается на технические характеристики изделия. Для ЦСП они следующие:
Разбег в показателях обусловлен разными размерами изделий и возможными отклонениями в составе. Особое внимание обращаем на горючесть и дымообразование: древесина пропитывается раствором и теряет воспламенительные способности. Как результат – горение не поддерживается, обеспечивается полная пожаробезопасность.
Другие особенности плит из стружки и цемента
Кроме технических характеристик профессионалы учитывают эксплуатационные качества строительного материала:
Устойчивость к влажности, но не воде, это нужно учитывать при выборе варианта монтажа и гидроизоляции;
Изделия легко обрабатываются обычным инструментом на строительной площадке;
В плитах не распространяется плесень и грибки, сохраняется однородность материала;
Изделие не растрескивается даже в увлажнённом состоянии из-за пористой структуры;
Возможно наносить любую отделку: краски, штукатурки, плитку и прочую обшивку;
В плитах отсутствуют вредные примеси типа связующих формальдегидных смол и асбеста.
Применение ЦСП
Цементно-стружечная плита получила широкое применение в отделке и строительстве.
Утепление
Плиты цементно-стружечные имеют низкий коэффициент теплопроводности, а по сравнению со специализированными теплоизоляционными материалами обладает высокой устойчивостью к горению и дымообразованию. По этой причине ЦПС часто используют в качестве самостоятельной теплоизоляции.
Для обшивки стен на рабочую поверхность устанавливают деревянную (обработанную антисептиком) обрешетку и монтируют утеплитель.
Плиты применяются при строительстве каркасных домов. Ими обшивают внутреннюю и внешнюю поверхность стен, а пространство внутри короба заполняют дополнительным утеплителем. Таким образом можно получить меньшую толщину стены.
При возведении складских и некоторых сельскохозяйственных сооружений методом каркасного строительства внутреннюю и внешнюю стены устанавливают в проектное положение, а пространство между ними оставляют пустым. Так можно достичь оптимальный уровень комфорта внутри здания, если не требуется усиленное утепление.
Фундаменты и монолитное бетонирование
Цементно-стружечная плита ЦСП может быть использована в качестве несъемной опалубки при заливке бетонного фундамента для частного дома. Для этого выбирают толстые листы 16-36 мм в зависимости от желаемого эффекта изоляции и массивности конструкции.
Несъемная опалубка для фундамента может быть гидроизолирована с наружной стороны битумной обмазкой или рулонными материалами – с поверхностью ЦСП можно работать разными материалами.
Таким же образом можно заливать цоколь и стены дома.
Внешняя отделка
Цементно-стружечная плита нашла применение для обшивки фасада. Как правило, это каркасное строительство, где вешние стороны стен обшивают ЦСП, но встречаются и отделки бетонных, кирпичных конструкций. Они дополнительно изолируют внутреннее тепло и создают базу для оштукатуривания и облицовки декоративными панелями.
Другое применение вне помещений:
Усиления теплоизоляции и звукоизоляции дверей,
Ограждения «теплых» балконов и лоджий;
Установки подоконных досок с внутренней и наружной стороны помещения.
Работы удобно проводить из-за податливости изделий обработке на строительной площадке.
Внутренняя отделка
Плиты ЦСП – отличный материал для быстрого сухого выравнивания поверхностей стен и потолков. Различные добавки в состав при производстве позволяют использовать изделия во влажных и мокрых помещениях.
Монтаж осуществляется на металлические или деревянные направляющие, выстроенные в каркас. Крепление плиты осуществляется на гвозди или саморезы. Могут применяться монтажные мастики, жидкие гвозди.
Изделия поддаются любой отделке:
Обои;
Оштукатуривание;
Облицовка плиткой.
Установка перегородок из ЦСП – популярный ход строителей. Таким образом можно достичь сразу нескольких целей:
Получение надежного и крепкого ограждения между помещениями;
Комнаты будут изолированы от звуков, потерей тепла без применения дополнительных прокладок;
Отсутствует потребность выравнивания поверхности ограждений, можно сразу приступать к чистовой отделке.
Полы
Цементно-стружечная плита для пола – отличный материал-подложка для чистовой отделки.
Для подвальных и подсобных помещений плиты можно укладывать непосредственно на грунт, проложив его предварительно гидроизоляционным материалом. Это снижает трудоемкость обустройства пола. Правда, использовать для этого можно только утолщенные изделия 20-36 мм.
Для полов во внутренних помещений ЦСП могут служить как основание и как выравнивающее покрытие. В первом случае укладка происходит на лаги, уложенные на расстоянии около 60 см друг от друга. Для выравнивания плиты укладываются на любое основание. Поверх них монтируется чистовая отделка пола.
Кровельный пирог
Кровля нуждается в утеплении, особенно, если под ней находится отапливаемое помещение. Плиты ЦСП подходят и для этих целей. Главное, что необходимо соблюсти – качественная и надежная гидроизоляция с внешней стороны и пароизоляция с внутренней.
Также панели могут служить обрешеткой под кровельное покрытие.
ЦСП — прочные и влагостойкие плиты для черновой отделки каркаса дома
Аббревиатуру ЦСП можно расшифровать и так, поскольку цементно-стружечные плиты по эксплуатационным характеристикам во многом превосходят другие древесные панели
Состав ЦСП
ЦСП (цементно-стружечная плита) приблизительно на треть состоит из стружки, и на две трети — из цемента. Порядка 3% от его объема составляют добавки, призванные упрочнить плиту, сделать ее влаго- и огнестойкой, а также «подружить» растительные волокна и бетон. Без использования химикатов эти материалы не смешиваются, прежде всего из-за сахаров, содержащихся в древесине. Важно, что среди используемых присадок нет опасных для человека или окружающей среды веществ, так что ЦСП можно с уверенностью назвать экологически чистым.
Но это не единственное достоинство материала. Он может служить хорошим теплоизолятором. Коэффициент теплопроводности цементно-стружечной плиты — 0,26 Вт/(м·К). Конечно, она уступает древесине с показателями 0,15 Вт/(м·К), но выигрывает у кирпичной кладки (0,7 Вт/(м·К), и оставляет далеко позади бетон (1,75 Вт/(м·К).
ЦСП является «дышащим» материалом, так что его можно без опасений использовать при внутренней отделке. Его паропроницаемость составляет 0,03 мг/(м·ч·Па) и это довольно высокие показатели.
Кроме того, ЦСП отличает высокая морозо- и влагостойкость. Его нельзя назвать абсолютно невосприимчивым к воде, но даже если замочить плиту на сутки, ее влажность поднимется всего на 7% — с 9% до 16%. При этом линейные размеры изделия и его толщина не изменятся настолько, чтобы это составляло проблему.
Материал прекрасно противостоит продольным деформациям, что позволяет использовать его для усиления несущей способности стен. Также следует отметить высокую прочность, способность к звукопоглощению и неподверженность атакам грибка, насекомых и мелких грызунов.
Длина плиты ЦСП варьируется от 2,7 до 3,2 м, толщина составляет 8-36 мм, ширина же всегда одна — 1,25 м
Неоспоримым плюсом цементно-стружечной плиты является огнестойкость (класс Г1). Она способна противостоять огню 50 минут. Но даже если материал все же воспламенится, он не будет выделять токсичные вещества.
Впрочем, наряду с достоинствами у ЦПС есть заметные недостатки. Прежде всего, это большой вес панелей, затрудняющий транспортировку и монтаж. Так, плита толщиной 36 мм и длиной 3,2 м весит почти 200 кг. Впрочем, обычно в строительстве используют панели 10-16 мм, весящие не более 85 кг. Работа с ними по силам бригаде из 3-4 человек.
Еще один серьезный недостаток ЦСП — слабая сопротивляемость изгибу — всего 9-12 Мпа. Для сооружения арок и других конструкций со скругленными линиями панели такого рода не подходят.
Область применения
Благодаря высокой морозо- и влагостойкости ЦСП можно использовать при наружных работах, причем это касается даже самых тонких листов — толщиной не более 8 мм.
Довольно часто ЦСП применяют для облицовки фасадов. Плиты, которые не прошли на производстве процедуру шлифовки, покрывают штукатуркой по армирующей сетке, а шлифованные грунтуют и окрашивают или оставляют в первозданном виде.
В каркасном домостроении плиты ЦСП используют для настила полов, а также в качестве наружной обшивки стен
Помимо этого ЦСП часто используют для опалубки. Из жестких, прочных, хорошо поддающихся обработке и практически неподверженных короблению плит можно собирать даже самые сложные формы. Если же опалубка несъемная, ЦСП служит ей еще и дополнительной гидро- и теплоизоляцией.
Более того, цементно-стружечные плиты могут быть и стеновым материалом. Точнее, они служат основой для сэндвич-панелей, которые позволяют собрать дом, как конструктор, за несколько недель.
Плиты ЦСП в конструкции пола
Если же говорить о внутренней отделке, тут ЦСП можно использовать практически без ограничений. Этот материал подходит для черновой обшивки стен, причем даже во влажных зонах. Шероховатые плиты оштукатуривают, оклеивают обоями, покрывают облицовочной плиткой и т.д. Из панелей большой толщины можно соорудить межкомнатную перегородку, закрепив их на металлическом или деревянном каркасе.
И наконец, цементно-стружечные плиты применяют для перекрытий. Их используют в конструкции полов, ими усиливают каркасы и повышают влагостойкость деревянных конструкций.
Цементно-стружечная плитка хорошо поддается механической обработке. Ее нетрудно пилить и сверлить. Установка крепежных элементов также не создает проблем
Что такое цементно-песчаная смесь (ЦПС), сфера ее использования
Цементно-песчаная смесь (ЦПС) – это смесь цемента и песка в различных пропорциях, в которой нет воды. Чаще всего в продаже встречается ЦПС, фасованная в мешки по 25 или 50 кг, но также существует ЦПС, которую поставляют непосредственно с цементных заводов в самосвалах. Последняя чаще всего используется для выкладывания тротуаров и дорог плиткой.
Плитка с намоченным основанием выкладывается на подушку из слоев щебенки и песка, на которую предварительно насыпали сухую ЦПС.
Можно ли использовать для этих целей не сухую ЦПС, а бетон: заливается бетонное основание, на которое кладется плитка. Можно, если решить проблему: между плитками после дождя скапливается вода, которая замерзнет в межсезонье. Это приведет к тому, что плитка оторвется от основания.
Сухая смесь, которая засыпается под плиты, лучше удерживает их на месте и упрощает укладку.
Для засыпки тротуарных швов можно использовать песок, но эту операцию придется систематически повторять
Также ЦПС нужно заполнять тротуарные швы. В целях экономии можно использовать песок, однако со временем процедуру придется повторять.
Как сухая ЦПС используется при укладке тротуарных плит
Перед использованием ЦПС для монтажа тротуарной плитки необходимо подготовить подушку (слой до 15 см) из щебня фракции 5–20 мм и крупного песка (слой от 3 до 5 см). В этом случае использование ЦПС не является обязательным.
Конструкции из тротуарных плит. Условные обозначения: 1 – плиты; 2 – песок или ЦПС; 3 – основания из ЦПС, бетона, песка, щебня, битумоминеральной смеси; 4 – песчаный морозозащитный слой; 5 – мелкоразмерные элементы мощения; 6 и 7 – полиэтиленовая пленка или геотекстиль типа дорнита; 8 – базальтовая сетка.
Если по дороге будут передвигаться легковые автомобили, подушка должна состоять из трех слоев:
Нижний слой из щебня фракции 10 – 40 мм. Толщина – 30 см.
Средний слой из щебня фракции 5–20 мм. Толщина – 5 см.
Верхний слой – ЦПС. Толщина – 5 см.
При создании подушки можно использовать геотекстиль, который разделяет щебень и песок или ЦПС, благодаря чему слои не смешиваются и улучшается дренаж воды. За счет этого замощенная площадка простоит больше времени.
Зимой ЦПС рекомендуется использовать при температуре не ниже -15 °С.
Обратите внимание: нельзя допускать разрыв во времени между укладкой ЦПС и монтажом плит.
В нашей компании можно заказать цементно-песчаную смесь по выгодной цене.
Строительные и отделочные материалы в Сургуте
География поставок компании СтройПлатформа распространена по территории всего Большого Урала, включающего в себя Свердловскую область, Ханты-Мансийский Автономный округ, Ямало-ненецкий автономный округ, Тюменскую область.
При необходимости, логистика осуществляется и в другие регионы.
Собственная служба логистики
Отгружаем свыше 250 тонн в день
40 машин на доставке
Доставляем до 150 заказов ежедневно.
По Сургуту доставка может быть осуществлена в день заказа, при соблюдении необходимых условий.
Доставка в регионы ХМАО и ЯНАО осуществляется в течение 2-5 дней после заказа.
Вы экономите до 30% на строительных материалах и их транспортировке. Эксклюзивные договоры с заводами-производителями, отсутствие брака, оптимизация смет и отлаженная логистика – гарантируют оптимальное предложение в виде соотношения цена-качество.
Мы предлагаем индивидуальное ценообразование для оптовых покупателей, и оптовые цены для розничных покупателей при комплексной поставке материалов на объект.
Наиболее востребованный во всем мире способ поставок строительных материалов на объект – полная комплектация от одного поставщика. Комплектация «Под ключ» наиболее удобная и экономически выгодная схема поставки строительных материалов. В компании «СтройПлатформа» вы можете купить по низким ценам стройматериалы:
Кровельные материалы (все для скатной и плоской кровли)
Фасадные системы (материалы для вентилируемых и штукатурных фасадов)
Стеновые материалы (кирпич, ЖБИ, газобетонные блоки, пазогребневые плиты)
Общестроительные и отделочные материалы (более 7000 наименований для строительства и ремонта)
Фундамент и благоустройство (качественные материалы для устройства гидроизоляции и утепления фундамента)
Мы не исчезнем и не подведем Вас. СтройПлатформа на 100% «белая» организация, которая может предоставить полный перечень закрывающих документов точно в срок.
Наши гарантии:
9 лет на рынке строительных материалов
12 000 м2 складской комплекс
Более 150 производителей – партнеры
7000 позиций товаров в ассортименте
25 специалистов отдела продаж на связи
+ 30% в год – динамика роста компании
Все это гарантирует вам успешность поставки и своевременное предоставление всех документов.
Мы обеспечиваем бесперебойную работу компании-заказчика за счет комплексного и профессионального снабжения объектов строительства.
Вы можете рассчитывать на техническую поддержку 24/7 – персональный менеджер подготовит расчет по чертежам заказчика, произведет техническое сравнение материалов и подберет оптимальное предложение по принципу цена-качество
На собственном складе компании в наличии 80% товаров из прайс-листа. Часть материалов отгружается со складов поставщиков в режиме работы компании благодаря надежным партнерским взаимоотношениям.
При заключении договора, вы можете рассчитывать на наличие материалов под ваши объекты, даже в сезон.
ЦПС М300 используется при закладке фундамента зданий, возведении стен,
сооружении каркасов и железобетонных конструкций, а также других сборных
элементов. Прекрасно подходит для выравнивания полов.
Материал ЦПС М300 отличается высокой прочностью и
устойчивостью к усадке. После приготовления раствор пригоден к использованию в
течение часа. ЦПС М300 можно наносить при температуре от +5Со до+35Со, при эксплуатации
материал выдерживает температуры в диапазоне от — 40Со до +70Со. Расход материала
для создания слоя толщиной 1 мм на различных поверхностях составляет 1.8-2.0 кг
на м2.
Технические характеристики ЦПС М 300
Состав:
Цементно песчаная смесь
Время использования готовой смеси
1 час (60 минут)
Кол-во воды для приготовления
раствора
0,14-0,16мл воды
Температура применения
От +5С до+35С
Морозостойкость
Около 25 циклов
Прочность сцепления с основанием
Не менее 0,5мПа
Прочность на сжатие
М300
Расход цпс М150 на 1мм слоя
1. 8-2.0 кг/м2
Температура эксплуатации
От -40С до +70С
Срок годности
12 месяцев
Тара, упаковка
25кг
% PDF-1.4
%
1 0 объект
> / Метаданные 2 0 R / Страницы 3 0 R / StructTreeRoot 5 0 R / Тип / Каталог >>
эндобдж
2 0 obj
> поток
2018-06-18T16: 12: 45-05: 002018-06-18T16: 12: 45-05: 002018-06-18T16: 12: 45-05: 00 Приложение Adobe InDesign CC 13.0 (Macintosh) / pdfuuid: 037c8cfe-508a -463c-8001-14f110ff5e79uuid: 93d4f83d-bf5e-4cad-9543-4f7f4fe42371 Adobe PDF Library 15.0 Ложь конечный поток
эндобдж
3 0 obj
>
эндобдж
5 0 obj
>
эндобдж
8 0 объект
>
эндобдж
9 0 объект
>
эндобдж
10 0 obj
>
эндобдж
11 0 объект
>
эндобдж
125 0 объект
>
эндобдж
126 0 объект
Посев образцов мочи с использованием элитной среды chromID CPS может ускорить идентификацию кишечной палочки и сократить время работы в клинической лаборатории
Реферат
Моча — один из наиболее распространенных типов образцов, отправляемых в лабораторию клинической микробиологии; Использование хромогенного агара — это один из методов, с помощью которого лаборатория может ускорить получение результатов посева и сократить время работы и материалы, необходимые для анализа посева мочи. Целью нашего исследования было сравнение хромогенной среды chromID CPS Elite (bioMérieux) с обычной первичной культуральной средой для оценки образцов мочи. Остаточные образцы мочи ( n = 200) инокулировали в обычные среды и в агар chromID CPS Elite (chromID). Время идентификации и использованные расходные материалы были задокументированы для обоих методов. Клинически значимый патоген (ы) был выделен из 51 культуры с использованием обычных сред, из которых Escherichia coli были наиболее часто выздоровевшими организмами ( n = 22).Степень точного совпадения уропатогенов между традиционной и хромогенной средами составила 82%, в то время как общее категориальное совпадение составило 83,5%. Временной интервал между посевом и окончательной идентификацией микроорганизмов был уменьшен с помощью хромированного агара по сравнению с традиционной средой для E. coli (в среднем 24,4 часа). против 27,1 ч, P <0,001). Используя chromID, клинически значимые культуры требовали меньше времени на обработку одной культуры (в среднем 1 мин и 2 с [1:02 мин]) по сравнению с обычными средами (в среднем 1:31 мин). Кроме того, для использования chromID потребовалось меньше расходных материалов (2,4 против 3,3 палочек и тампонов) и быстрые биохимические тесты (1,0 против 1,9) по сравнению с обычными средами. Примечательно, что тестирование на чувствительность к противомикробным препаратам продемонстрировало хорошее общее согласие (97,4%) между chromID и обычными средами для всех протестированных антибиотиков. chromID CPS Elite обеспечивает точную идентификацию уропатогенов, снижает расход расходных материалов и может ускорить идентификацию E. coli в клинических образцах.
ВВЕДЕНИЕ
Инфекции мочевыводящих путей (ИМП) являются одними из самых распространенных бактериальных инфекций во всем мире (1).Скрининг посевов мочи для выявления значимых уропатогенов может потребовать значительного времени, использования расходных материалов и биохимических тестов. В результате посевы мочи для подтверждения диагноза ИМП составляют основную часть рабочей нагрузки микробиологических лабораторий (2), которые сталкиваются с нехваткой квалифицированного лабораторного персонала (3). Таким образом, существует потребность в точных методах, позволяющих сэкономить время и снизить рабочую нагрузку. Кроме того, все большее внимание уделяется ускорению получения результатов посева от пациентов с инфекцией; минимизация окна диагностической неопределенности имеет важное значение для оптимизации противомикробной терапии и улучшения результатов лечения пациентов (4).
Одним из подходов к рационализации посева мочи является быстрая идентификация организмов, выросших на твердом агаре, с использованием матричной лазерной десорбционной ионизации, времяпролетной масс-спектрометрии (MALDI-TOF MS). Было показано, что этот метод является точным и экономичным для идентификации бактериальных и грибковых организмов (5, –15). Однако до MALDI-TOF MS может потребоваться значительное время для выделения значительных уропатогенов из стандартной среды, особенно для пациентов со смешанными инфекциями.
Большинство осложненных и неосложненных ИМП вызывается Escherichia coli и другими микроорганизмами, такими как Klebsiella pneumoniae , Staphylococcus saprophyticus , Enterococcus spp. И стрептококками группы B, вносящими значительный вклад в стрептококки группы B (GBS). часть эпидемиологии ИМП (16). Поскольку этиология большинства ИМП ограничивается несколькими микроорганизмами, культивирование уропатогенов можно использовать с использованием хромогенного агара, что может минимизировать время обработки и необходимые расходные материалы.В нескольких исследованиях оценивали коммерчески доступные хромогенные агары для идентификации распространенных уропатогенов (17, –20). Недавно выпущенный в продажу хромогенный агар, агар chromID CPS Elite (chromID) (bioMérieux, Дарем, Северная Каролина), облегчает выделение и идентификацию нескольких распространенных возбудителей ИМП по характеристикам их колоний. Основным преимуществом этой среды является способность непосредственно идентифицировать E. coli . В сочетании с окрашиванием по Граму среда chromID также позволяет предположительно идентифицировать Enterococcus spp., некоторые представители группы Enterobacteriaceae и представители группы Proteeae ( Proteus , Providencia и Morganella ). Для этих организмов окончательная идентификация требует биохимического тестирования или анализа MALDI-TOF MS. Целью нашего исследования было сравнить эффективность chromID с использованием обычных сред для первичной культивирования образцов мочи. Для каждого типа среды оценивалась точность обнаружения уропатогенов, время работы, использование расходных материалов и время, необходимое для идентификации.Кроме того, была оценена точность теста на чувствительность к противомикробным препаратам, проведенного непосредственно с хромогенного агара, и проведено сравнение со стандартными средами.
(Это исследование было частично представлено в виде стендовой презентации [плакат Friday-330] в ASM Microbe, Бостон, Массачусетс, июнь 2016 г.)
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
Субъекты.
После получения одобрения Наблюдательного совета Вашингтонского университета 200 деидентифицированных образцов остаточной мочи были отправлены в микробиологическую лабораторию больницы Барнс-Еврей (Св. Луи, Миссури) в рамках рутинной клинической помощи были случайным образом выбраны для включения в это исследование. Двадцать образцов в неделю оценивали в течение 10 недель. Для включения в исследование образцы должны были быть обработаны в течение 24 часов после сбора и отправлены в транспортные пробирки BD с серым верхом для культивирования мочи. Были собраны основные демографические данные субъектов, включая пол, возраст, больничное отделение и статус стационарного пациента.
Методы культивирования.
Мочу высевали с использованием калиброванной петли для посева на 1 мкл с поперечной полосой на обычную кровь и агар МакКонки (Харди, Санта-Мария, Калифорния) и на хромогенный агар chromID CPS Elite (bioMérieux).Планшеты устанавливали и инкубировали партиями по пять штук, разделенных 30 минутами каждая, чтобы обеспечить точное время последующего рабочего процесса. Культуры инкубировали от 22 до 24 ч при 35 ° C на воздухе. Контроль качества хромИД проводился согласно рекомендациям производителя.
Идентификация микроорганизмов и тестирование на чувствительность к противомикробным препаратам.
Обычные среды и среды chromID считывались и интерпретировались в соответствии с критериями стандартной рабочей процедуры для посева мочи в лаборатории клинической микробиологии.Рост одного или двух отдельных организмов при пороге 50 000 КОЕ / мл был классифицирован как клинически значимый рост. Присутствие трех или более организмов, количество каждого из которых превышает пороговое значение, было классифицировано как зараженное. Все исследования клинически значимых организмов выполнялись в соответствии с вкладышем в упаковку для среды chromID. Клинически значимые организмы были идентифицированы с помощью Vitek MS v2.0 (bioMérieux) непосредственно из обычных или хромированных сред (11, –13, 15). На каждом этапе обследования и идентификации с помощью секундомера документировалось время работы и расходные материалы как для обычных, так и для хромогенных методов.
Тестирование чувствительности к антибиотикам (AST), если указано, проводилось непосредственно вне рутинной среды или среды chromID с использованием дисковой диффузии Кирби-Бауэра в соответствии с лабораторным протоколом для данного типа организма. При необходимости для анализа противоречий регистрировались размеры зон. AST и интерпретация результатов выполнялись в соответствии с рекомендациями Института клинических и лабораторных стандартов (CLSI) (21, 22). Все препараты оценивались на соответствие категории, и любые ошибки классифицировались.
Сравнение непрозрачных и полупрозрачных сред chromID CPS.
Среда chromID доступна в полупрозрачном или непрозрачном формате, которые идентичны по составу, за исключением непрозрачности среды. Для сравнения полупрозрачного или непрозрачного агара chromID CPS Elite случайным образом была отобрана подгруппа из 50 растущих образцов, которые культивировали одновременно как со средой chromID CPS Elite, так и со средой chromID CPS Elite OPAQUE с использованием 1-мкл петли. Идентификацию и количественную оценку организмов проводили для каждого типа среды и сравнивали.Для сравнения AST культуры с клинически значимым ростом тестировали непосредственно из сред chromID CPS Elite и chromID CPS Elite OPAQUE. Согласие AST было проанализировано по соглашению категорий, как описано выше.
Статистический анализ.
По завершении сравнения был проведен статистический анализ для определения точности и оценки различий во времени работы, времени представления результатов и использованных материалах. Для точности категориальное соответствие каждой культуры и точное соответствие группе или видовому уровню каждого изолята сравнивали между chromID и обычными средами.Категорическое согласие было определено как одна и та же классификация (клинически значимая, загрязненная, клинически незначимая или отсутствие роста) между стандартной и хромогенной средами для одного и того же образца. Двусторонние тесты t (парные и непарные, в зависимости от каждого сравнения) использовались для сравнения различий во времени работы, времени до представления результатов и использованных материалах. Все анализы были выполнены с использованием SAS / STAT версии 9.1 системы SAS.
РЕЗУЛЬТАТЫ
Темы.
Всего было оценено 200 деидентифицированных образцов остатков, которые были отправлены для посева мочи. Эти образцы были собраны у субъектов в возрасте от 14 до 100 лет (в среднем 52 года; в среднем 54 года), причем 60% субъектов составляли женщины. В общей сложности 45% образцов были собраны в стационарах.
Точность chromID CPS.
Образцы мочи помещали на агар с хромидом, и рост сравнивали с традиционной средой в качестве стандартного метода сравнения.Из 200 культур 61 была классифицирована на обычных средах как не имеющие роста, 72 продемонстрировали клинически незначительный рост и 16 были загрязнены на обычном агаре (). По сравнению с обычными средами, меньшее количество образцов было классифицировано как загрязненные ( n = 12) или клинически незначимые ( n = 62) с помощью хромид-агара, что привело к категориальному положительному совпадению 68,8 и 73,6%, соответственно, между двумя методами. . В целом, клинически значимые патогены были выделены из 51 культуры с E. coli как наиболее часто выздоравливающий организм ( n = 22). Члены групп Enterobacteriaceae и Proteeae представляли 11 и 2 особи соответственно. Грамположительные организмы, выделенные в значительных количествах из обычных сред, включали Enterococcus spp. ( n = 6) и Staphylococcus spp. ( п = 2). Смешанные инфекции были выявлены в семи значимых культурах. Из 51 клинически значимой культуры chromID классифицировал 45 как значимые (88.2% положительное категориальное согласие) (). При рассмотрении исключительно уропатогенов степень точного соответствия между обычными и хромогенными средами составила 82%, а общее категориальное согласие составило 83,5%. Хотя Vitek MS не был одобрен Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США (FDA) для тестирования непосредственно с хромогенной среды, результаты тестирования MALDI-TOF MS с этой средой совпадают с результатами тестирования с использованием крови или агара МакКонки.
ТАБЛИЦА 1
Категориальное соответствие между обычными средами и носителями chromID
Категория
No.положительных результатов
% категориальное согласие
Оба метода
Только традиционные
Только хромогенные
Клинически значимые
45
6
90ram отрицательные
Escherichia coli
20
2
0
Другие Enterobacteriaceae7 9013 9013 9013 9013 9013 9013 Enterobacteriaceae7 Proteeae
2
0
1
Pseudomonas aeruginosa
2
0
0
грамм
Enterococcus spp.
6
0
0
Staphylococcus spp.
1
1
0
Стрептококк группы B a
0
1
0
9135
Lactobac
0
3
0
Другие грамположительные бактерии
2
0
0
Дрожжи
Всего
51
7
1
Клинически незначимо
53
19
9
74
906 11 5
Отсутствие роста
58
3
23
95
Из несоответствий между обычным и хромогенным агаром, организмы, которые не были выделены в клинически значимых количествах на chromID, включали стрептококки группы B (GBS; n = 1), Lactobacillus ( n = 3), E. coli ( n = 2) и коагулазонегативные стафилококки (ЦНС; n = 1). В одном образце со смешанной инфекцией Proteus mirabilis был выделен из chromID, но не из обычных сред. Примечательно, что GBS был выделен из пяти образцов, классифицированных как незначительные или загрязненные на обычных средах, но не был выделен ни в каком количестве из соответствующей культуры на хромогенных средах.
Анализ рабочего времени и расходных материалов.
Время обработки каждого образца и количество расходных материалов, быстрые биохимические тесты (каталаза, оксидаза и индол) и планшеты для пересева, необходимые для идентификации, регистрировались для каждого типа среды.Время, необходимое для обработки образцов на хромогенных средах (среднее, 1:02 [мин: с]; диапазон, 0: 05–3: 16), было значительно меньше для клинически значимых культур по сравнению с обычными средами ( среднее 1:31; диапазон 0: 40–4: 41) ( P = 0,003) (). Из клинически значимых образцов для агара chromID потребовалось меньше быстрых биохимических тестов (в среднем 1,04 против 1,92) и меньше анализа MALDI-TOF MS для идентификации (в среднем 0,73 против 1,06) по сравнению с обычными средами (). Большинство этих различий было связано с культурами чистой E. coli , у которых было значительно меньшее время практической работы (в среднем 0:20 по сравнению с 1:24 м: сс), использование расходных материалов (среднее 0,33 против 3,33) и быстрые биохимические анализы (среднее 0,22 против 2,22) и необходимость идентификации MALDI-TOF MS (среднее 0,11 против 1,11) по сравнению с обычными средами. Не было обнаружено значительных различий в необходимости окрашивания по Граму или пересева для любой категории посева мочи ().
ТАБЛИЦА 2
Оценка практического времени и расходных материалов для хромИДа по сравнению с обычными средами
Параметр
Все культуры
Клинически значимые
Культуры с E.coli
Обычный ( n = 200)
chromID ( n = 200)
P
Обычный ( n = 51)
chromID ( n = 45)
P
Обычный ( n = 18)
chromID ( n = 18)
P
Время работы вручную (мин: с)
Среднее значение
0:45
0:24
0. 029
1:31
1:02
0,003
1:24
0:20
<0,0001
Медиана
0:13
0:06
37
37
1:11
1:19
0:10
Диапазон
0: 03–30: 08
0: 02–3: 16
0: 40– 4:41
0: 05–3: 16
0: 57–2: 10
0: 05–1: 59
Использованные расходные материалы a ( n )
Среднее
0. 99
0,68
0,052
3,33
2,44
0,029
3,33
0,33
<0,0001
Медиана 3
0
0
0
0
0
0
Диапазон
0–8
0–9
1–8
0–9
3–6
0–6
0–6
Пятна по Граму ( n )
Среднее
0. 12
0,16
0,373
0,37
0,62
0,053
0,11
0,00
0,163
Медиана
0
0
0
0
0
Диапазон
0–2
0–2
0–1
0–2
0–1
0
b ( n )
Среднее
0. 59
0,29
0,0005
1,92
1,04
<0,0001
2,22
0,22
<0,0001
Медиана
0
0
0
2
0
Диапазон
0–4
0–4
0–4
0–4
2–4
0–2
Планшеты для субкультуры ( n )
Среднее
0. 01
0,03
0,203
0,04
0,09
0,41
0,00
0,06
0,331
медиана
0
0
0
0
0
Диапазон
0–1
0–2
0–1
0–2
0
0–1
M ( n )
Среднее
0. 30
0,21
0,117
1,06
0,73
0,028
1,11
0,11
<0,0001
Медиана
0
0
0
0
0
0
0
0
0
Диапазон
0–2
0–3
0–2
0–3
1–2
0–6
0–6
Для каждого образца регистрировалось общее время от посева до предварительной идентификации до уровня рода или группы, окончательной идентификации и окончательного отчета о тестировании на чувствительность к противомикробным препаратам. Важно отметить, что предварительная идентификация на уровне рода может быть получена только для одной значимой культуры, помещенной в обычную среду, по сравнению с 17 культурами из хромогенной среды (данные не показаны). Сравнение времени, необходимого для окончательной идентификации уропатогенов в клинически значимых культурах, не обнаружило существенной разницы между chromID и традиционной средой (26,6 против 27,2 ч, P = 0,550). Сравнение подмножества клинически значимых культур, в которых выросли чистые E.coli показал значительное сокращение времени до окончательной идентификации E. coli с хромогенными средами по сравнению с обычными средами (24,4 ч против 27,1 ч, P = <0,0001) (). Однако не было замечено никакой разницы во времени до окончательного отчета о результатах тестирования на чувствительность к противомикробным препаратам для всех культур, включая культуры, в которых E. coli было выделено в чистой культуре (). Изоляты, выделенные в количествах, превышающих пороговое значение для значимости, за исключением CNS, Lactobacillus spp. , и GBS, были подвергнуты АСТ. Результаты установки AST непосредственно из хромогенных сред сравнивали с результатами, полученными с использованием стандартных процедур, в которых среды AST были засеяны из обычного агара. Из 33 протестированных изолятов Enterobacteriaceae было обнаружено шесть незначительных ошибок, четыре основных ошибки и никаких очень серьезных ошибок, когда AST был установлен непосредственно из хромогенной среды (). Пять ошибок произошли на двух изолятах, а остальные пять — на пяти разных изолятах. Для Enterococcus spp.( n = 6), только четыре незначительные ошибки произошли при AST с chromID, состоящие из одной ошибки для ванкомицина, ципрофлоксацина и доксициклина для одного и того же изолята и одной ошибки для линезолида на другом изоляте. Не было ошибок в AST для Staphylococcus aureus ( n = 1) или Pseudomonas aeruginosa ( n = 2).
ТАБЛИЦА 3
Анализ времени до идентификации и времени до окончательного отчета для chromID и традиционных носителей a
Сравнение непрозрачной и полупрозрачной среды chromID.
Сравнение подгруппы образцов ( n = 50) было выполнено для полупрозрачной и непрозрачной среды chromID. Используя полупрозрачную среду, образцы были классифицированы как отрицательные ( n = 6), загрязненные ( n = 3), незначительные ( n = 20) и клинически значимые ( n = 21) (с ростом из E. coli [ n = 9], Enterococcus spp. [ n = 5], K. pneumoniae [ n = 3], P.mirabilis [ n = 2], P. aeruginosa [ n = 2], Enterobacter cloacae комплекс [ n = 1], Serratia marcescens [ n = 1], S aureus [ n = 1] и дрожжи [ n = 1] с четырьмя смешанными инфекциями). Интерпретация культур для двух сред показала 98% категориальное согласие, при этом один образец был классифицирован как незначительный на полупрозрачной среде и загрязненный на непрозрачной среде (данные не показаны).Кроме того, AST для подгруппы клинически значимых образцов сравнивали между прозрачной и непрозрачной средой chromID. Согласование категорий для AST для всех протестированных препаратов и изолятов было 100% между полупрозрачной и непрозрачной средами (данные не показаны).
ОБСУЖДЕНИЕ
Агар chromID CPS Elite продемонстрировал высокий уровень согласия с обычными средами для результатов культивирования и тестирования образцов мочи на чувствительность к антибиотикам. Это согласуется с предыдущими исследованиями нескольких хромогенных сред для посева мочи, показывающими, что эти среды сопоставимы с обычными средами для выделения уропатогенов (17, 19, 23, 24).Одно предыдущее исследование оценивало эффективность агара chromID CPS Elite и показало, что как непрозрачная, так и полупрозрачная среды были более чувствительны для обнаружения и идентификации уропатогенов, чем предыдущая среда CPS ID4 от того же производителя (20). Однако потенциальное влияние на клиническую лабораторию использования хромогенной среды для посева мочи, такое как использование расходных материалов, время обработки и тестирование на чувствительность к антибиотикам, в этих предыдущих исследованиях не оценивалось.
В целом, распределение уропатогенов, выделенных из образцов мочи, использованных в этом исследовании, было репрезентативным для организмов, обычно выделяемых как от осложненных, так и от неосложненных ИМП (16). Как и ожидалось, наиболее часто выделяемым уропатогеном в этом исследовании был E. coli . Расхождения были отмечены в двух образцах, в которых E. coli было идентифицировано в значительном количестве из обычного агара, тогда как хромИД классифицировал образцы как загрязненные или незначительные.От обоих образцов на хромогенном агаре отмечен рост E. coli . Однако в одном образце уровень роста был ниже порога клинической значимости. В другом образце два дополнительных типа колоний сверх порогового значения можно было выделить из отдельной морфологии колонии E. coli на хромогенной среде. Таким образом, этот образец был классифицирован как загрязненный. Вероятно, что эти колонии нельзя было дифференцировать на обычных средах, что привело к тому, что этот образец был классифицирован как клинически значимый рост E.coli . Этот результат согласуется с предыдущими исследованиями, демонстрирующими повышенную способность хромогенных сред изолировать смешанный рост уропатогенов из образцов мочи (23, 25). Это дополнительно подтверждается в нашем исследовании выделением P. mirabilis из одного образца мочи в значительных количествах с E. coli из хромогенного агара, в то время как E. coli отдельно было выделено из обычных сред.
Подавление роста нормальной периуретральной флоры с помощью среды chromID может упростить рабочий процесс в клинических микробиологических лабораториях за счет уменьшения количества образцов, классифицируемых как «клинически незначимые».Это наблюдалось в настоящем исследовании и, вероятно, способствовало значительному сокращению рабочего времени для обработки культур в целом. Напротив, ингибирование периуретральной флоры средой с хромИД также может объяснить, почему агар с хромИД не смог восстановить количества, превышающие пороговое значение Lactobacillus spp. в трех экземплярах и ГБС с одного экземпляра. Кроме того, хромогенные среды не смогли выделить GBS в любом количестве из пяти образцов, в которых GBS был отмечен на обычных средах.В предыдущих исследованиях сообщалось о несоответствиях в способности хромогенных сред точно идентифицировать GBS по образцам мочи (17, 23). Это может быть проблемой для лабораторий, которые сообщают о любом количестве бактериурии с GBS в образцах, полученных от женщин детородного возраста, и это следует учитывать, если эта среда используется отдельно для посева образцов мочи.
В то время как в предыдущем исследовании анализировалось время обработки хромогенного агара chromID CPS4, сравнение времени обработки для стандартной среды не проводилось из-за различий в протоколе (19).В других исследованиях сообщалось о сокращении времени обработки посева мочи с хромогенными средами (23, 26). Однако оценка сэкономленного времени основывалась на экстраполяции практического времени для всех культур на основе заранее определенного среднего времени обработки или ретроспективного анализа временных меток, полученных из лабораторной информационной системы. В последнее время в лабораториях клинической микробиологии резко изменились лабораторные рабочие процессы и требования к персоналу (3, 27). В настоящем исследовании каждый этап обработки каждого отдельного образца выполнялся одним технологом и записывался с помощью секундомера, чтобы конкретно и объективно оценить разницу во времени работы между хромогенными и традиционными средами.Мы наблюдали вариабельность практического времени между образцами в зависимости от количества и типа роста организмов, что подтверждает, что использование расчетного времени обработки для каждой культуры не может быть широко применимо ко всем образцам мочи.
Мы обнаружили, что время практической работы с культурами E. coli с использованием chromID было уменьшено в среднем более чем на 1 минуту на образец, что может быть связано со способностью непосредственно идентифицировать E. coli с помощью chromID на основа внешнего вида колонии без необходимости окрашивания по Граму или биохимического анализа.Поскольку E. coli представляют собой подавляющее большинство положительных культур мочи, это может существенно изменить время обработки для лабораторий клинической микробиологии. Уменьшение количества зараженных и несущественных культур с chromID, вероятно, способствовало значительному сокращению времени, необходимого для обработки хромогенных сред для всех культур по сравнению с обычными средами. Кроме того, значительное сокращение использования расходных материалов, быстрых биохимических тестов и необходимость MALDI-TOF MS для идентификации организмов, вероятно, добавили к сокращению времени практического применения, показанному для всех клинически значимых культур.Используя данные, собранные в этом исследовании, в среднем 21 секунду практического времени, сэкономленного на культуру с хромид-агаром, гипотетическая лаборатория, обрабатывающая 50000 посевов мочи в год, сэкономила бы почти 292 часа, или 36,5 рабочих дней (т. Е. 8 часов дней), практического времени обработки ежегодно. При ориентировочной стоимости в 5 долларов за одну чашку с агаром с chromID по сравнению с примерно 0,50 долларов за каждую чашку с кровяным агаром и агаром МакКонки, эта теоретическая лаборатория будет тратить дополнительно 200000 долларов в год на среды для культивирования мочи.Данные этого исследования показывают, что экономия расходных материалов и рабочего времени может частично компенсировать рост затрат. Возможная дополнительная экономия может быть достигнута за счет последующего воздействия на уход за пациентами или продолжительность пребывания в больнице, хотя в этом исследовании не рассматриваются исходы для пациентов. Кроме того, эти затраты представляют собой только оценки, которые не принимают во внимание региональные различия в ценах и различия в контрактах на закупку с учреждениями.
Среда chromID позволяет предварительно идентифицировать несколько микроорганизмов до уровня рода или группы на основе окраски по Граму и внешнего вида колоний.Такая быстрая идентификация может быть полезной, поскольку она может ускорить получение результатов и уменьшить неопределенность при выборе подходящей антибактериальной терапии, особенно для стационарных пациентов со сложными ИМП, для которых лечение может быть своевременно изменено. Примечательно, что предварительная идентификация на уровне рода или группы в этом исследовании произошла для 17 образцов, помещенных на хромID, в то время как только один образец из традиционной среды удалось предварительно идентифицировать. Из-за возможности напрямую идентифицировать E.coli из хромогенных сред, время до окончательной идентификации E. coli было значительно сокращено по сравнению с обычными средами. Однако не было отмечено различий во времени до окончательной идентификации других уропатогенов из-за необходимости окрашивания по Граму и дальнейшего тестирования для окончательной идентификации на обоих типах сред. Кроме того, не было измерено никаких существенных различий за время до окончательного отчета по какой-либо культуре. Это согласуется с предыдущим отчетом, в котором не было продемонстрировано значительной разницы во времени оборота между до и после введения ориентировочной среды CHROMagar для идентификации уропатогенов в лаборатории клинической микробиологии (26).
Хромогенные среды не одобрены FDA для проведения MALDI-TOF MS или тестирования антимикробной чувствительности непосредственно без пересева на обычные среды; это может задержать получение результатов примерно на 1 день. Анализ чувствительности, проведенный с помощью chromID, продемонстрировал точные результаты, без каких-либо серьезных ошибок, связанных с хромогенным агаром; это согласуется с предыдущим исследованием более ранней итерации среды chromID, агара chromID CPS3, в котором была установлена достоверность AST непосредственно из этой среды (24).Кроме того, идентификация MALDI-TOF MS была успешно и точно выполнена непосредственно с агара chromID.
Хотя подробный анализ, проведенный в этом исследовании, является сильной стороной этого исследования, он не лишен ограничений. Это одноцентровое исследование с ограниченным размером выборки. Кроме того, вполне вероятно, что более значительные различия будут наблюдаться в отношении времени и времени на идентификацию для лабораторий, которые полагаются на обычные биохимические методы, а не на MALDI-TOF MS для идентификации бактерий.Поскольку для анализа использовались деидентифицированные образцы, корреляция результатов посева с клинической картиной или анализом мочи была невозможна. Наконец, в этом наборе образцов отсутствовали уропатогены, которые могут быть важными причинами ИМП, такие как Staphylococcus saprophyticus , Aerococcus urinae и Corynebacterium urealyticum . Таким образом, эффективность этой среды для этих организмов не могла быть оценена.
Это исследование демонстрирует, что характеристики среды chromID сравнимы с характеристиками обычных сред в сочетании с идентификацией MALDI-TOF MS для наиболее распространенных уропатогенов.Практическое время и расходные материалы были сокращены с использованием chromID по сравнению с обычными средами для клинически значимых культур, особенно культур E. coli . Это преимущество может компенсировать повышенную стоимость хромогенных сред по сравнению со стандартными питательными средами (24, 26, 28). В то время как появляющиеся и необычные уропатогены, вероятно, потребуют традиционных методов идентификации, агар chromID CPS Elite может быть реальной альтернативой обычным средам для выделения и идентификации наиболее распространенных уропатогенов в образцах мочи.
Посев образцов мочи с использованием элитной среды chromID CPS может ускорить идентификацию кишечной палочки и сократить время работы в клинической лаборатории
Реферат
Моча — один из наиболее распространенных типов образцов, отправляемых в лабораторию клинической микробиологии; Использование хромогенного агара — это один из методов, с помощью которого лаборатория может ускорить получение результатов посева и сократить время работы и материалы, необходимые для анализа посева мочи. Целью нашего исследования было сравнение хромогенной среды chromID CPS Elite (bioMérieux) с обычной первичной культуральной средой для оценки образцов мочи.Остаточные образцы мочи ( n = 200) инокулировали в обычные среды и в агар chromID CPS Elite (chromID). Время идентификации и использованные расходные материалы были задокументированы для обоих методов. Клинически значимый патоген (ы) был выделен из 51 культуры с использованием обычных сред, из которых Escherichia coli были наиболее часто выздоровевшими организмами ( n = 22). Степень точного совпадения уропатогенов между традиционной и хромогенной средами составила 82%, в то время как общее категориальное совпадение было 83.5%. Временной интервал между посевом и окончательной идентификацией микроорганизмов был уменьшен с помощью хромированного агара по сравнению с обычной средой для E. coli (в среднем 24,4 часа по сравнению с 27,1 часа, P <0,001). Используя chromID, клинически значимые культуры требовали меньше времени на обработку одной культуры (в среднем 1 мин и 2 с [1:02 мин]) по сравнению с обычными средами (в среднем 1:31 мин). Кроме того, для использования chromID потребовалось меньше расходных материалов (2,4 против 3,3 палочек и тампонов) и быстрые биохимические тесты (1,0 против 1,9) по сравнению с обычными средами.Примечательно, что тестирование на чувствительность к противомикробным препаратам продемонстрировало хорошее общее согласие (97,4%) между chromID и обычными средами для всех протестированных антибиотиков. chromID CPS Elite обеспечивает точную идентификацию уропатогенов, снижает расход расходных материалов и может ускорить идентификацию E. coli в клинических образцах.
ВВЕДЕНИЕ
Инфекции мочевыводящих путей (ИМП) являются одними из самых распространенных бактериальных инфекций во всем мире (1). Скрининг посевов мочи для выявления значимых уропатогенов может потребовать значительного времени, использования расходных материалов и биохимических тестов.В результате посевы мочи для подтверждения диагноза ИМП составляют основную часть рабочей нагрузки микробиологических лабораторий (2), которые сталкиваются с нехваткой квалифицированного лабораторного персонала (3). Таким образом, существует потребность в точных методах, позволяющих сэкономить время и снизить рабочую нагрузку. Кроме того, все большее внимание уделяется ускорению получения результатов посева от пациентов с инфекцией; минимизация окна диагностической неопределенности имеет важное значение для оптимизации противомикробной терапии и улучшения результатов лечения пациентов (4).
Одним из подходов к рационализации посева мочи является быстрая идентификация организмов, выросших на твердом агаре, с использованием матричной лазерной десорбционной ионизации, времяпролетной масс-спектрометрии (MALDI-TOF MS). Было показано, что этот метод является точным и экономичным для идентификации бактериальных и грибковых организмов (5, –15). Однако до MALDI-TOF MS может потребоваться значительное время для выделения значительных уропатогенов из стандартной среды, особенно для пациентов со смешанными инфекциями.
Большинство осложненных и неосложненных ИМП вызывается Escherichia coli и другими микроорганизмами, такими как Klebsiella pneumoniae , Staphylococcus saprophyticus , Enterococcus spp. И стрептококками группы B, вносящими значительный вклад в стрептококки группы B (GBS). часть эпидемиологии ИМП (16). Поскольку этиология большинства ИМП ограничивается несколькими микроорганизмами, культивирование уропатогенов можно использовать с использованием хромогенного агара, что может минимизировать время обработки и необходимые расходные материалы.В нескольких исследованиях оценивали коммерчески доступные хромогенные агары для идентификации распространенных уропатогенов (17, –20). Недавно выпущенный в продажу хромогенный агар, агар chromID CPS Elite (chromID) (bioMérieux, Дарем, Северная Каролина), облегчает выделение и идентификацию нескольких распространенных возбудителей ИМП по характеристикам их колоний. Основным преимуществом этой среды является способность непосредственно идентифицировать E. coli . В сочетании с окрашиванием по Граму среда chromID также позволяет предположительно идентифицировать Enterococcus spp., некоторые представители группы Enterobacteriaceae и представители группы Proteeae ( Proteus , Providencia и Morganella ). Для этих организмов окончательная идентификация требует биохимического тестирования или анализа MALDI-TOF MS. Целью нашего исследования было сравнить эффективность chromID с использованием обычных сред для первичной культивирования образцов мочи. Для каждого типа среды оценивалась точность обнаружения уропатогенов, время работы, использование расходных материалов и время, необходимое для идентификации.Кроме того, была оценена точность теста на чувствительность к противомикробным препаратам, проведенного непосредственно с хромогенного агара, и проведено сравнение со стандартными средами.
(Это исследование было частично представлено в виде стендовой презентации [плакат Friday-330] в ASM Microbe, Бостон, Массачусетс, июнь 2016 г.)
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
Субъекты.
После получения одобрения Наблюдательного совета Вашингтонского университета 200 деидентифицированных образцов остаточной мочи были отправлены в микробиологическую лабораторию больницы Барнс-Еврей (Св.Луи, Миссури) в рамках рутинной клинической помощи были случайным образом выбраны для включения в это исследование. Двадцать образцов в неделю оценивали в течение 10 недель. Для включения в исследование образцы должны были быть обработаны в течение 24 часов после сбора и отправлены в транспортные пробирки BD с серым верхом для культивирования мочи. Были собраны основные демографические данные субъектов, включая пол, возраст, больничное отделение и статус стационарного пациента.
Методы культивирования.
Мочу высевали с использованием калиброванной петли для посева на 1 мкл с поперечной полосой на обычную кровь и агар МакКонки (Харди, Санта-Мария, Калифорния) и на хромогенный агар chromID CPS Elite (bioMérieux).Планшеты устанавливали и инкубировали партиями по пять штук, разделенных 30 минутами каждая, чтобы обеспечить точное время последующего рабочего процесса. Культуры инкубировали от 22 до 24 ч при 35 ° C на воздухе. Контроль качества хромИД проводился согласно рекомендациям производителя.
Идентификация микроорганизмов и тестирование на чувствительность к противомикробным препаратам.
Обычные среды и среды chromID считывались и интерпретировались в соответствии с критериями стандартной рабочей процедуры для посева мочи в лаборатории клинической микробиологии.Рост одного или двух отдельных организмов при пороге 50 000 КОЕ / мл был классифицирован как клинически значимый рост. Присутствие трех или более организмов, количество каждого из которых превышает пороговое значение, было классифицировано как зараженное. Все исследования клинически значимых организмов выполнялись в соответствии с вкладышем в упаковку для среды chromID. Клинически значимые организмы были идентифицированы с помощью Vitek MS v2.0 (bioMérieux) непосредственно из обычных или хромированных сред (11, –13, 15). На каждом этапе обследования и идентификации с помощью секундомера документировалось время работы и расходные материалы как для обычных, так и для хромогенных методов.
Тестирование чувствительности к антибиотикам (AST), если указано, проводилось непосредственно вне рутинной среды или среды chromID с использованием дисковой диффузии Кирби-Бауэра в соответствии с лабораторным протоколом для данного типа организма. При необходимости для анализа противоречий регистрировались размеры зон. AST и интерпретация результатов выполнялись в соответствии с рекомендациями Института клинических и лабораторных стандартов (CLSI) (21, 22). Все препараты оценивались на соответствие категории, и любые ошибки классифицировались.
Сравнение непрозрачных и полупрозрачных сред chromID CPS.
Среда chromID доступна в полупрозрачном или непрозрачном формате, которые идентичны по составу, за исключением непрозрачности среды. Для сравнения полупрозрачного или непрозрачного агара chromID CPS Elite случайным образом была отобрана подгруппа из 50 растущих образцов, которые культивировали одновременно как со средой chromID CPS Elite, так и со средой chromID CPS Elite OPAQUE с использованием 1-мкл петли. Идентификацию и количественную оценку организмов проводили для каждого типа среды и сравнивали.Для сравнения AST культуры с клинически значимым ростом тестировали непосредственно из сред chromID CPS Elite и chromID CPS Elite OPAQUE. Согласие AST было проанализировано по соглашению категорий, как описано выше.
Статистический анализ.
По завершении сравнения был проведен статистический анализ для определения точности и оценки различий во времени работы, времени представления результатов и использованных материалах. Для точности категориальное соответствие каждой культуры и точное соответствие группе или видовому уровню каждого изолята сравнивали между chromID и обычными средами.Категорическое согласие было определено как одна и та же классификация (клинически значимая, загрязненная, клинически незначимая или отсутствие роста) между стандартной и хромогенной средами для одного и того же образца. Двусторонние тесты t (парные и непарные, в зависимости от каждого сравнения) использовались для сравнения различий во времени работы, времени до представления результатов и использованных материалах. Все анализы были выполнены с использованием SAS / STAT версии 9.1 системы SAS.
РЕЗУЛЬТАТЫ
Темы.
Всего было оценено 200 деидентифицированных образцов остатков, которые были отправлены для посева мочи. Эти образцы были собраны у субъектов в возрасте от 14 до 100 лет (в среднем 52 года; в среднем 54 года), причем 60% субъектов составляли женщины. В общей сложности 45% образцов были собраны в стационарах.
Точность chromID CPS.
Образцы мочи помещали на агар с хромидом, и рост сравнивали с традиционной средой в качестве стандартного метода сравнения.Из 200 культур 61 была классифицирована на обычных средах как не имеющие роста, 72 продемонстрировали клинически незначительный рост и 16 были загрязнены на обычном агаре (). По сравнению с обычными средами, меньшее количество образцов было классифицировано как загрязненные ( n = 12) или клинически незначимые ( n = 62) с помощью хромид-агара, что привело к категориальному положительному совпадению 68,8 и 73,6%, соответственно, между двумя методами. . В целом, клинически значимые патогены были выделены из 51 культуры с E.coli как наиболее часто выздоравливающий организм ( n = 22). Члены групп Enterobacteriaceae и Proteeae представляли 11 и 2 особи соответственно. Грамположительные организмы, выделенные в значительных количествах из обычных сред, включали Enterococcus spp. ( n = 6) и Staphylococcus spp. ( п = 2). Смешанные инфекции были выявлены в семи значимых культурах. Из 51 клинически значимой культуры chromID классифицировал 45 как значимые (88.2% положительное категориальное согласие) (). При рассмотрении исключительно уропатогенов степень точного соответствия между обычными и хромогенными средами составила 82%, а общее категориальное согласие составило 83,5%. Хотя Vitek MS не был одобрен Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США (FDA) для тестирования непосредственно с хромогенной среды, результаты тестирования MALDI-TOF MS с этой средой совпадают с результатами тестирования с использованием крови или агара МакКонки.
ТАБЛИЦА 1
Категориальное соответствие между обычными средами и носителями chromID
Категория
No.положительных результатов
% категориальное согласие
Оба метода
Только традиционные
Только хромогенные
Клинически значимые
45
6
90ram отрицательные
Escherichia coli
20
2
0
Другие Enterobacteriaceae7 9013 9013 9013 9013 9013 9013 Enterobacteriaceae7 Proteeae
2
0
1
Pseudomonas aeruginosa
2
0
0
грамм
Enterococcus spp.
6
0
0
Staphylococcus spp.
1
1
0
Стрептококк группы B a
0
1
0
9135
Lactobac
0
3
0
Другие грамположительные бактерии
2
0
0
Дрожжи
Всего
51
7
1
Клинически незначимо
53
19
9
74
906 11 5
Отсутствие роста
58
3
23
95
Из несоответствий между обычным и хромогенным агаром, организмы, которые не были выделены в клинически значимых количествах на chromID, включали стрептококки группы B (GBS; n = 1), Lactobacillus ( n = 3), E.coli ( n = 2) и коагулазонегативные стафилококки (ЦНС; n = 1). В одном образце со смешанной инфекцией Proteus mirabilis был выделен из chromID, но не из обычных сред. Примечательно, что GBS был выделен из пяти образцов, классифицированных как незначительные или загрязненные на обычных средах, но не был выделен ни в каком количестве из соответствующей культуры на хромогенных средах.
Анализ рабочего времени и расходных материалов.
Время обработки каждого образца и количество расходных материалов, быстрые биохимические тесты (каталаза, оксидаза и индол) и планшеты для пересева, необходимые для идентификации, регистрировались для каждого типа среды.Время, необходимое для обработки образцов на хромогенных средах (среднее, 1:02 [мин: с]; диапазон, 0: 05–3: 16), было значительно меньше для клинически значимых культур по сравнению с обычными средами ( среднее 1:31; диапазон 0: 40–4: 41) ( P = 0,003) (). Из клинически значимых образцов для агара chromID потребовалось меньше быстрых биохимических тестов (в среднем 1,04 против 1,92) и меньше анализа MALDI-TOF MS для идентификации (в среднем 0,73 против 1,06) по сравнению с обычными средами ().Большинство этих различий было связано с культурами чистой E. coli , у которых было значительно меньшее время практической работы (в среднем 0:20 по сравнению с 1:24 м: сс), использование расходных материалов (среднее 0,33 против 3,33) и быстрые биохимические анализы (среднее 0,22 против 2,22) и необходимость идентификации MALDI-TOF MS (среднее 0,11 против 1,11) по сравнению с обычными средами. Не было обнаружено значительных различий в необходимости окрашивания по Граму или пересева для любой категории посева мочи ().
ТАБЛИЦА 2
Оценка практического времени и расходных материалов для хромИДа по сравнению с обычными средами
Параметр
Все культуры
Клинически значимые
Культуры с E.coli
Обычный ( n = 200)
chromID ( n = 200)
P
Обычный ( n = 51)
chromID ( n = 45)
P
Обычный ( n = 18)
chromID ( n = 18)
P
Время работы вручную (мин: с)
Среднее значение
0:45
0:24
0.029
1:31
1:02
0,003
1:24
0:20
<0,0001
Медиана
0:13
0:06
37
37
1:11
1:19
0:10
Диапазон
0: 03–30: 08
0: 02–3: 16
0: 40– 4:41
0: 05–3: 16
0: 57–2: 10
0: 05–1: 59
Использованные расходные материалы a ( n )
Среднее
0.99
0,68
0,052
3,33
2,44
0,029
3,33
0,33
<0,0001
Медиана 3
0
0
0
0
0
0
Диапазон
0–8
0–9
1–8
0–9
3–6
0–6
0–6
Пятна по Граму ( n )
Среднее
0.12
0,16
0,373
0,37
0,62
0,053
0,11
0,00
0,163
Медиана
0
0
0
0
0
Диапазон
0–2
0–2
0–1
0–2
0–1
0
b ( n )
Среднее
0.59
0,29
0,0005
1,92
1,04
<0,0001
2,22
0,22
<0,0001
Медиана
0
0
0
2
0
Диапазон
0–4
0–4
0–4
0–4
2–4
0–2
Планшеты для субкультуры ( n )
Среднее
0.01
0,03
0,203
0,04
0,09
0,41
0,00
0,06
0,331
медиана
0
0
0
0
0
Диапазон
0–1
0–2
0–1
0–2
0
0–1
M ( n )
Среднее
0.30
0,21
0,117
1,06
0,73
0,028
1,11
0,11
<0,0001
Медиана
0
0
0
0
0
0
0
0
0
Диапазон
0–2
0–3
0–2
0–3
1–2
0–6
0–6
Для каждого образца регистрировалось общее время от посева до предварительной идентификации до уровня рода или группы, окончательной идентификации и окончательного отчета о тестировании на чувствительность к противомикробным препаратам.Важно отметить, что предварительная идентификация на уровне рода может быть получена только для одной значимой культуры, помещенной в обычную среду, по сравнению с 17 культурами из хромогенной среды (данные не показаны). Сравнение времени, необходимого для окончательной идентификации уропатогенов в клинически значимых культурах, не обнаружило существенной разницы между chromID и традиционной средой (26,6 против 27,2 ч, P = 0,550). Сравнение подмножества клинически значимых культур, в которых выросли чистые E.coli показал значительное сокращение времени до окончательной идентификации E. coli с хромогенными средами по сравнению с обычными средами (24,4 ч против 27,1 ч, P = <0,0001) (). Однако не было замечено никакой разницы во времени до окончательного отчета о результатах тестирования на чувствительность к противомикробным препаратам для всех культур, включая культуры, в которых E. coli было выделено в чистой культуре (). Изоляты, выделенные в количествах, превышающих пороговое значение для значимости, за исключением CNS, Lactobacillus spp., и GBS, были подвергнуты АСТ. Результаты установки AST непосредственно из хромогенных сред сравнивали с результатами, полученными с использованием стандартных процедур, в которых среды AST были засеяны из обычного агара. Из 33 протестированных изолятов Enterobacteriaceae было обнаружено шесть незначительных ошибок, четыре основных ошибки и никаких очень серьезных ошибок, когда AST был установлен непосредственно из хромогенной среды (). Пять ошибок произошли на двух изолятах, а остальные пять — на пяти разных изолятах. Для Enterococcus spp.( n = 6), только четыре незначительные ошибки произошли при AST с chromID, состоящие из одной ошибки для ванкомицина, ципрофлоксацина и доксициклина для одного и того же изолята и одной ошибки для линезолида на другом изоляте. Не было ошибок в AST для Staphylococcus aureus ( n = 1) или Pseudomonas aeruginosa ( n = 2).
ТАБЛИЦА 3
Анализ времени до идентификации и времени до окончательного отчета для chromID и традиционных носителей a
Сравнение непрозрачной и полупрозрачной среды chromID.
Сравнение подгруппы образцов ( n = 50) было выполнено для полупрозрачной и непрозрачной среды chromID. Используя полупрозрачную среду, образцы были классифицированы как отрицательные ( n = 6), загрязненные ( n = 3), незначительные ( n = 20) и клинически значимые ( n = 21) (с ростом из E. coli [ n = 9], Enterococcus spp. [ n = 5], K. pneumoniae [ n = 3], P.mirabilis [ n = 2], P. aeruginosa [ n = 2], Enterobacter cloacae комплекс [ n = 1], Serratia marcescens [ n = 1], S aureus [ n = 1] и дрожжи [ n = 1] с четырьмя смешанными инфекциями). Интерпретация культур для двух сред показала 98% категориальное согласие, при этом один образец был классифицирован как незначительный на полупрозрачной среде и загрязненный на непрозрачной среде (данные не показаны).Кроме того, AST для подгруппы клинически значимых образцов сравнивали между прозрачной и непрозрачной средой chromID. Согласование категорий для AST для всех протестированных препаратов и изолятов было 100% между полупрозрачной и непрозрачной средами (данные не показаны).
ОБСУЖДЕНИЕ
Агар chromID CPS Elite продемонстрировал высокий уровень согласия с обычными средами для результатов культивирования и тестирования образцов мочи на чувствительность к антибиотикам. Это согласуется с предыдущими исследованиями нескольких хромогенных сред для посева мочи, показывающими, что эти среды сопоставимы с обычными средами для выделения уропатогенов (17, 19, 23, 24).Одно предыдущее исследование оценивало эффективность агара chromID CPS Elite и показало, что как непрозрачная, так и полупрозрачная среды были более чувствительны для обнаружения и идентификации уропатогенов, чем предыдущая среда CPS ID4 от того же производителя (20). Однако потенциальное влияние на клиническую лабораторию использования хромогенной среды для посева мочи, такое как использование расходных материалов, время обработки и тестирование на чувствительность к антибиотикам, в этих предыдущих исследованиях не оценивалось.
В целом, распределение уропатогенов, выделенных из образцов мочи, использованных в этом исследовании, было репрезентативным для организмов, обычно выделяемых как от осложненных, так и от неосложненных ИМП (16). Как и ожидалось, наиболее часто выделяемым уропатогеном в этом исследовании был E. coli . Расхождения были отмечены в двух образцах, в которых E. coli было идентифицировано в значительном количестве из обычного агара, тогда как хромИД классифицировал образцы как загрязненные или незначительные.От обоих образцов на хромогенном агаре отмечен рост E. coli . Однако в одном образце уровень роста был ниже порога клинической значимости. В другом образце два дополнительных типа колоний сверх порогового значения можно было выделить из отдельной морфологии колонии E. coli на хромогенной среде. Таким образом, этот образец был классифицирован как загрязненный. Вероятно, что эти колонии нельзя было дифференцировать на обычных средах, что привело к тому, что этот образец был классифицирован как клинически значимый рост E.coli . Этот результат согласуется с предыдущими исследованиями, демонстрирующими повышенную способность хромогенных сред изолировать смешанный рост уропатогенов из образцов мочи (23, 25). Это дополнительно подтверждается в нашем исследовании выделением P. mirabilis из одного образца мочи в значительных количествах с E. coli из хромогенного агара, в то время как E. coli отдельно было выделено из обычных сред.
Подавление роста нормальной периуретральной флоры с помощью среды chromID может упростить рабочий процесс в клинических микробиологических лабораториях за счет уменьшения количества образцов, классифицируемых как «клинически незначимые».Это наблюдалось в настоящем исследовании и, вероятно, способствовало значительному сокращению рабочего времени для обработки культур в целом. Напротив, ингибирование периуретральной флоры средой с хромИД также может объяснить, почему агар с хромИД не смог восстановить количества, превышающие пороговое значение Lactobacillus spp. в трех экземплярах и ГБС с одного экземпляра. Кроме того, хромогенные среды не смогли выделить GBS в любом количестве из пяти образцов, в которых GBS был отмечен на обычных средах.В предыдущих исследованиях сообщалось о несоответствиях в способности хромогенных сред точно идентифицировать GBS по образцам мочи (17, 23). Это может быть проблемой для лабораторий, которые сообщают о любом количестве бактериурии с GBS в образцах, полученных от женщин детородного возраста, и это следует учитывать, если эта среда используется отдельно для посева образцов мочи.
В то время как в предыдущем исследовании анализировалось время обработки хромогенного агара chromID CPS4, сравнение времени обработки для стандартной среды не проводилось из-за различий в протоколе (19).В других исследованиях сообщалось о сокращении времени обработки посева мочи с хромогенными средами (23, 26). Однако оценка сэкономленного времени основывалась на экстраполяции практического времени для всех культур на основе заранее определенного среднего времени обработки или ретроспективного анализа временных меток, полученных из лабораторной информационной системы. В последнее время в лабораториях клинической микробиологии резко изменились лабораторные рабочие процессы и требования к персоналу (3, 27). В настоящем исследовании каждый этап обработки каждого отдельного образца выполнялся одним технологом и записывался с помощью секундомера, чтобы конкретно и объективно оценить разницу во времени работы между хромогенными и традиционными средами.Мы наблюдали вариабельность практического времени между образцами в зависимости от количества и типа роста организмов, что подтверждает, что использование расчетного времени обработки для каждой культуры не может быть широко применимо ко всем образцам мочи.
Мы обнаружили, что время практической работы с культурами E. coli с использованием chromID было уменьшено в среднем более чем на 1 минуту на образец, что может быть связано со способностью непосредственно идентифицировать E. coli с помощью chromID на основа внешнего вида колонии без необходимости окрашивания по Граму или биохимического анализа.Поскольку E. coli представляют собой подавляющее большинство положительных культур мочи, это может существенно изменить время обработки для лабораторий клинической микробиологии. Уменьшение количества зараженных и несущественных культур с chromID, вероятно, способствовало значительному сокращению времени, необходимого для обработки хромогенных сред для всех культур по сравнению с обычными средами. Кроме того, значительное сокращение использования расходных материалов, быстрых биохимических тестов и необходимость MALDI-TOF MS для идентификации организмов, вероятно, добавили к сокращению времени практического применения, показанному для всех клинически значимых культур.Используя данные, собранные в этом исследовании, в среднем 21 секунду практического времени, сэкономленного на культуру с хромид-агаром, гипотетическая лаборатория, обрабатывающая 50000 посевов мочи в год, сэкономила бы почти 292 часа, или 36,5 рабочих дней (т. Е. 8 часов дней), практического времени обработки ежегодно. При ориентировочной стоимости в 5 долларов за одну чашку с агаром с chromID по сравнению с примерно 0,50 долларов за каждую чашку с кровяным агаром и агаром МакКонки, эта теоретическая лаборатория будет тратить дополнительно 200000 долларов в год на среды для культивирования мочи.Данные этого исследования показывают, что экономия расходных материалов и рабочего времени может частично компенсировать рост затрат. Возможная дополнительная экономия может быть достигнута за счет последующего воздействия на уход за пациентами или продолжительность пребывания в больнице, хотя в этом исследовании не рассматриваются исходы для пациентов. Кроме того, эти затраты представляют собой только оценки, которые не принимают во внимание региональные различия в ценах и различия в контрактах на закупку с учреждениями.
Среда chromID позволяет предварительно идентифицировать несколько микроорганизмов до уровня рода или группы на основе окраски по Граму и внешнего вида колоний.Такая быстрая идентификация может быть полезной, поскольку она может ускорить получение результатов и уменьшить неопределенность при выборе подходящей антибактериальной терапии, особенно для стационарных пациентов со сложными ИМП, для которых лечение может быть своевременно изменено. Примечательно, что предварительная идентификация на уровне рода или группы в этом исследовании произошла для 17 образцов, помещенных на хромID, в то время как только один образец из традиционной среды удалось предварительно идентифицировать. Из-за возможности напрямую идентифицировать E.coli из хромогенных сред, время до окончательной идентификации E. coli было значительно сокращено по сравнению с обычными средами. Однако не было отмечено различий во времени до окончательной идентификации других уропатогенов из-за необходимости окрашивания по Граму и дальнейшего тестирования для окончательной идентификации на обоих типах сред. Кроме того, не было измерено никаких существенных различий за время до окончательного отчета по какой-либо культуре. Это согласуется с предыдущим отчетом, в котором не было продемонстрировано значительной разницы во времени оборота между до и после введения ориентировочной среды CHROMagar для идентификации уропатогенов в лаборатории клинической микробиологии (26).
Хромогенные среды не одобрены FDA для проведения MALDI-TOF MS или тестирования антимикробной чувствительности непосредственно без пересева на обычные среды; это может задержать получение результатов примерно на 1 день. Анализ чувствительности, проведенный с помощью chromID, продемонстрировал точные результаты, без каких-либо серьезных ошибок, связанных с хромогенным агаром; это согласуется с предыдущим исследованием более ранней итерации среды chromID, агара chromID CPS3, в котором была установлена достоверность AST непосредственно из этой среды (24).Кроме того, идентификация MALDI-TOF MS была успешно и точно выполнена непосредственно с агара chromID.
Хотя подробный анализ, проведенный в этом исследовании, является сильной стороной этого исследования, он не лишен ограничений. Это одноцентровое исследование с ограниченным размером выборки. Кроме того, вполне вероятно, что более значительные различия будут наблюдаться в отношении времени и времени на идентификацию для лабораторий, которые полагаются на обычные биохимические методы, а не на MALDI-TOF MS для идентификации бактерий.Поскольку для анализа использовались деидентифицированные образцы, корреляция результатов посева с клинической картиной или анализом мочи была невозможна. Наконец, в этом наборе образцов отсутствовали уропатогены, которые могут быть важными причинами ИМП, такие как Staphylococcus saprophyticus , Aerococcus urinae и Corynebacterium urealyticum . Таким образом, эффективность этой среды для этих организмов не могла быть оценена.
Это исследование демонстрирует, что характеристики среды chromID сравнимы с характеристиками обычных сред в сочетании с идентификацией MALDI-TOF MS для наиболее распространенных уропатогенов.Практическое время и расходные материалы были сокращены с использованием chromID по сравнению с обычными средами для клинически значимых культур, особенно культур E. coli . Это преимущество может компенсировать повышенную стоимость хромогенных сред по сравнению со стандартными питательными средами (24, 26, 28). В то время как появляющиеся и необычные уропатогены, вероятно, потребуют традиционных методов идентификации, агар chromID CPS Elite может быть реальной альтернативой обычным средам для выделения и идентификации наиболее распространенных уропатогенов в образцах мочи.
Посев образцов мочи с использованием элитной среды chromID CPS может ускорить идентификацию кишечной палочки и сократить время работы в клинической лаборатории
Реферат
Моча — один из наиболее распространенных типов образцов, отправляемых в лабораторию клинической микробиологии; Использование хромогенного агара — это один из методов, с помощью которого лаборатория может ускорить получение результатов посева и сократить время работы и материалы, необходимые для анализа посева мочи. Целью нашего исследования было сравнение хромогенной среды chromID CPS Elite (bioMérieux) с обычной первичной культуральной средой для оценки образцов мочи.Остаточные образцы мочи ( n = 200) инокулировали в обычные среды и в агар chromID CPS Elite (chromID). Время идентификации и использованные расходные материалы были задокументированы для обоих методов. Клинически значимый патоген (ы) был выделен из 51 культуры с использованием обычных сред, из которых Escherichia coli были наиболее часто выздоровевшими организмами ( n = 22). Степень точного совпадения уропатогенов между традиционной и хромогенной средами составила 82%, в то время как общее категориальное совпадение было 83.5%. Временной интервал между посевом и окончательной идентификацией микроорганизмов был уменьшен с помощью хромированного агара по сравнению с обычной средой для E. coli (в среднем 24,4 часа по сравнению с 27,1 часа, P <0,001). Используя chromID, клинически значимые культуры требовали меньше времени на обработку одной культуры (в среднем 1 мин и 2 с [1:02 мин]) по сравнению с обычными средами (в среднем 1:31 мин). Кроме того, для использования chromID потребовалось меньше расходных материалов (2,4 против 3,3 палочек и тампонов) и быстрые биохимические тесты (1,0 против 1,9) по сравнению с обычными средами.Примечательно, что тестирование на чувствительность к противомикробным препаратам продемонстрировало хорошее общее согласие (97,4%) между chromID и обычными средами для всех протестированных антибиотиков. chromID CPS Elite обеспечивает точную идентификацию уропатогенов, снижает расход расходных материалов и может ускорить идентификацию E. coli в клинических образцах.
ВВЕДЕНИЕ
Инфекции мочевыводящих путей (ИМП) являются одними из самых распространенных бактериальных инфекций во всем мире (1). Скрининг посевов мочи для выявления значимых уропатогенов может потребовать значительного времени, использования расходных материалов и биохимических тестов.В результате посевы мочи для подтверждения диагноза ИМП составляют основную часть рабочей нагрузки микробиологических лабораторий (2), которые сталкиваются с нехваткой квалифицированного лабораторного персонала (3). Таким образом, существует потребность в точных методах, позволяющих сэкономить время и снизить рабочую нагрузку. Кроме того, все большее внимание уделяется ускорению получения результатов посева от пациентов с инфекцией; минимизация окна диагностической неопределенности имеет важное значение для оптимизации противомикробной терапии и улучшения результатов лечения пациентов (4).
Одним из подходов к рационализации посева мочи является быстрая идентификация организмов, выросших на твердом агаре, с использованием матричной лазерной десорбционной ионизации, времяпролетной масс-спектрометрии (MALDI-TOF MS). Было показано, что этот метод является точным и экономичным для идентификации бактериальных и грибковых организмов (5, –15). Однако до MALDI-TOF MS может потребоваться значительное время для выделения значительных уропатогенов из стандартной среды, особенно для пациентов со смешанными инфекциями.
Большинство осложненных и неосложненных ИМП вызывается Escherichia coli и другими микроорганизмами, такими как Klebsiella pneumoniae , Staphylococcus saprophyticus , Enterococcus spp. И стрептококками группы B, вносящими значительный вклад в стрептококки группы B (GBS). часть эпидемиологии ИМП (16). Поскольку этиология большинства ИМП ограничивается несколькими микроорганизмами, культивирование уропатогенов можно использовать с использованием хромогенного агара, что может минимизировать время обработки и необходимые расходные материалы.В нескольких исследованиях оценивали коммерчески доступные хромогенные агары для идентификации распространенных уропатогенов (17, –20). Недавно выпущенный в продажу хромогенный агар, агар chromID CPS Elite (chromID) (bioMérieux, Дарем, Северная Каролина), облегчает выделение и идентификацию нескольких распространенных возбудителей ИМП по характеристикам их колоний. Основным преимуществом этой среды является способность непосредственно идентифицировать E. coli . В сочетании с окрашиванием по Граму среда chromID также позволяет предположительно идентифицировать Enterococcus spp., некоторые представители группы Enterobacteriaceae и представители группы Proteeae ( Proteus , Providencia и Morganella ). Для этих организмов окончательная идентификация требует биохимического тестирования или анализа MALDI-TOF MS. Целью нашего исследования было сравнить эффективность chromID с использованием обычных сред для первичной культивирования образцов мочи. Для каждого типа среды оценивалась точность обнаружения уропатогенов, время работы, использование расходных материалов и время, необходимое для идентификации.Кроме того, была оценена точность теста на чувствительность к противомикробным препаратам, проведенного непосредственно с хромогенного агара, и проведено сравнение со стандартными средами.
(Это исследование было частично представлено в виде стендовой презентации [плакат Friday-330] в ASM Microbe, Бостон, Массачусетс, июнь 2016 г.)
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
Субъекты.
После получения одобрения Наблюдательного совета Вашингтонского университета 200 деидентифицированных образцов остаточной мочи были отправлены в микробиологическую лабораторию больницы Барнс-Еврей (Св.Луи, Миссури) в рамках рутинной клинической помощи были случайным образом выбраны для включения в это исследование. Двадцать образцов в неделю оценивали в течение 10 недель. Для включения в исследование образцы должны были быть обработаны в течение 24 часов после сбора и отправлены в транспортные пробирки BD с серым верхом для культивирования мочи. Были собраны основные демографические данные субъектов, включая пол, возраст, больничное отделение и статус стационарного пациента.
Методы культивирования.
Мочу высевали с использованием калиброванной петли для посева на 1 мкл с поперечной полосой на обычную кровь и агар МакКонки (Харди, Санта-Мария, Калифорния) и на хромогенный агар chromID CPS Elite (bioMérieux).Планшеты устанавливали и инкубировали партиями по пять штук, разделенных 30 минутами каждая, чтобы обеспечить точное время последующего рабочего процесса. Культуры инкубировали от 22 до 24 ч при 35 ° C на воздухе. Контроль качества хромИД проводился согласно рекомендациям производителя.
Идентификация микроорганизмов и тестирование на чувствительность к противомикробным препаратам.
Обычные среды и среды chromID считывались и интерпретировались в соответствии с критериями стандартной рабочей процедуры для посева мочи в лаборатории клинической микробиологии.Рост одного или двух отдельных организмов при пороге 50 000 КОЕ / мл был классифицирован как клинически значимый рост. Присутствие трех или более организмов, количество каждого из которых превышает пороговое значение, было классифицировано как зараженное. Все исследования клинически значимых организмов выполнялись в соответствии с вкладышем в упаковку для среды chromID. Клинически значимые организмы были идентифицированы с помощью Vitek MS v2.0 (bioMérieux) непосредственно из обычных или хромированных сред (11, –13, 15). На каждом этапе обследования и идентификации с помощью секундомера документировалось время работы и расходные материалы как для обычных, так и для хромогенных методов.
Тестирование чувствительности к антибиотикам (AST), если указано, проводилось непосредственно вне рутинной среды или среды chromID с использованием дисковой диффузии Кирби-Бауэра в соответствии с лабораторным протоколом для данного типа организма. При необходимости для анализа противоречий регистрировались размеры зон. AST и интерпретация результатов выполнялись в соответствии с рекомендациями Института клинических и лабораторных стандартов (CLSI) (21, 22). Все препараты оценивались на соответствие категории, и любые ошибки классифицировались.
Сравнение непрозрачных и полупрозрачных сред chromID CPS.
Среда chromID доступна в полупрозрачном или непрозрачном формате, которые идентичны по составу, за исключением непрозрачности среды. Для сравнения полупрозрачного или непрозрачного агара chromID CPS Elite случайным образом была отобрана подгруппа из 50 растущих образцов, которые культивировали одновременно как со средой chromID CPS Elite, так и со средой chromID CPS Elite OPAQUE с использованием 1-мкл петли. Идентификацию и количественную оценку организмов проводили для каждого типа среды и сравнивали.Для сравнения AST культуры с клинически значимым ростом тестировали непосредственно из сред chromID CPS Elite и chromID CPS Elite OPAQUE. Согласие AST было проанализировано по соглашению категорий, как описано выше.
Статистический анализ.
По завершении сравнения был проведен статистический анализ для определения точности и оценки различий во времени работы, времени представления результатов и использованных материалах. Для точности категориальное соответствие каждой культуры и точное соответствие группе или видовому уровню каждого изолята сравнивали между chromID и обычными средами.Категорическое согласие было определено как одна и та же классификация (клинически значимая, загрязненная, клинически незначимая или отсутствие роста) между стандартной и хромогенной средами для одного и того же образца. Двусторонние тесты t (парные и непарные, в зависимости от каждого сравнения) использовались для сравнения различий во времени работы, времени до представления результатов и использованных материалах. Все анализы были выполнены с использованием SAS / STAT версии 9.1 системы SAS.
РЕЗУЛЬТАТЫ
Темы.
Всего было оценено 200 деидентифицированных образцов остатков, которые были отправлены для посева мочи. Эти образцы были собраны у субъектов в возрасте от 14 до 100 лет (в среднем 52 года; в среднем 54 года), причем 60% субъектов составляли женщины. В общей сложности 45% образцов были собраны в стационарах.
Точность chromID CPS.
Образцы мочи помещали на агар с хромидом, и рост сравнивали с традиционной средой в качестве стандартного метода сравнения.Из 200 культур 61 была классифицирована на обычных средах как не имеющие роста, 72 продемонстрировали клинически незначительный рост и 16 были загрязнены на обычном агаре (). По сравнению с обычными средами, меньшее количество образцов было классифицировано как загрязненные ( n = 12) или клинически незначимые ( n = 62) с помощью хромид-агара, что привело к категориальному положительному совпадению 68,8 и 73,6%, соответственно, между двумя методами. . В целом, клинически значимые патогены были выделены из 51 культуры с E.coli как наиболее часто выздоравливающий организм ( n = 22). Члены групп Enterobacteriaceae и Proteeae представляли 11 и 2 особи соответственно. Грамположительные организмы, выделенные в значительных количествах из обычных сред, включали Enterococcus spp. ( n = 6) и Staphylococcus spp. ( п = 2). Смешанные инфекции были выявлены в семи значимых культурах. Из 51 клинически значимой культуры chromID классифицировал 45 как значимые (88.2% положительное категориальное согласие) (). При рассмотрении исключительно уропатогенов степень точного соответствия между обычными и хромогенными средами составила 82%, а общее категориальное согласие составило 83,5%. Хотя Vitek MS не был одобрен Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США (FDA) для тестирования непосредственно с хромогенной среды, результаты тестирования MALDI-TOF MS с этой средой совпадают с результатами тестирования с использованием крови или агара МакКонки.
ТАБЛИЦА 1
Категориальное соответствие между обычными средами и носителями chromID
Категория
No.положительных результатов
% категориальное согласие
Оба метода
Только традиционные
Только хромогенные
Клинически значимые
45
6
90ram отрицательные
Escherichia coli
20
2
0
Другие Enterobacteriaceae7 9013 9013 9013 9013 9013 9013 Enterobacteriaceae7 Proteeae
2
0
1
Pseudomonas aeruginosa
2
0
0
грамм
Enterococcus spp.
6
0
0
Staphylococcus spp.
1
1
0
Стрептококк группы B a
0
1
0
9135
Lactobac
0
3
0
Другие грамположительные бактерии
2
0
0
Дрожжи
Всего
51
7
1
Клинически незначимо
53
19
9
74
906 11 5
Отсутствие роста
58
3
23
95
Из несоответствий между обычным и хромогенным агаром, организмы, которые не были выделены в клинически значимых количествах на chromID, включали стрептококки группы B (GBS; n = 1), Lactobacillus ( n = 3), E.coli ( n = 2) и коагулазонегативные стафилококки (ЦНС; n = 1). В одном образце со смешанной инфекцией Proteus mirabilis был выделен из chromID, но не из обычных сред. Примечательно, что GBS был выделен из пяти образцов, классифицированных как незначительные или загрязненные на обычных средах, но не был выделен ни в каком количестве из соответствующей культуры на хромогенных средах.
Анализ рабочего времени и расходных материалов.
Время обработки каждого образца и количество расходных материалов, быстрые биохимические тесты (каталаза, оксидаза и индол) и планшеты для пересева, необходимые для идентификации, регистрировались для каждого типа среды.Время, необходимое для обработки образцов на хромогенных средах (среднее, 1:02 [мин: с]; диапазон, 0: 05–3: 16), было значительно меньше для клинически значимых культур по сравнению с обычными средами ( среднее 1:31; диапазон 0: 40–4: 41) ( P = 0,003) (). Из клинически значимых образцов для агара chromID потребовалось меньше быстрых биохимических тестов (в среднем 1,04 против 1,92) и меньше анализа MALDI-TOF MS для идентификации (в среднем 0,73 против 1,06) по сравнению с обычными средами ().Большинство этих различий было связано с культурами чистой E. coli , у которых было значительно меньшее время практической работы (в среднем 0:20 по сравнению с 1:24 м: сс), использование расходных материалов (среднее 0,33 против 3,33) и быстрые биохимические анализы (среднее 0,22 против 2,22) и необходимость идентификации MALDI-TOF MS (среднее 0,11 против 1,11) по сравнению с обычными средами. Не было обнаружено значительных различий в необходимости окрашивания по Граму или пересева для любой категории посева мочи ().
ТАБЛИЦА 2
Оценка практического времени и расходных материалов для хромИДа по сравнению с обычными средами
Параметр
Все культуры
Клинически значимые
Культуры с E.coli
Обычный ( n = 200)
chromID ( n = 200)
P
Обычный ( n = 51)
chromID ( n = 45)
P
Обычный ( n = 18)
chromID ( n = 18)
P
Время работы вручную (мин: с)
Среднее значение
0:45
0:24
0.029
1:31
1:02
0,003
1:24
0:20
<0,0001
Медиана
0:13
0:06
37
37
1:11
1:19
0:10
Диапазон
0: 03–30: 08
0: 02–3: 16
0: 40– 4:41
0: 05–3: 16
0: 57–2: 10
0: 05–1: 59
Использованные расходные материалы a ( n )
Среднее
0.99
0,68
0,052
3,33
2,44
0,029
3,33
0,33
<0,0001
Медиана 3
0
0
0
0
0
0
Диапазон
0–8
0–9
1–8
0–9
3–6
0–6
0–6
Пятна по Граму ( n )
Среднее
0.12
0,16
0,373
0,37
0,62
0,053
0,11
0,00
0,163
Медиана
0
0
0
0
0
Диапазон
0–2
0–2
0–1
0–2
0–1
0
b ( n )
Среднее
0.59
0,29
0,0005
1,92
1,04
<0,0001
2,22
0,22
<0,0001
Медиана
0
0
0
2
0
Диапазон
0–4
0–4
0–4
0–4
2–4
0–2
Планшеты для субкультуры ( n )
Среднее
0.01
0,03
0,203
0,04
0,09
0,41
0,00
0,06
0,331
медиана
0
0
0
0
0
Диапазон
0–1
0–2
0–1
0–2
0
0–1
M ( n )
Среднее
0.30
0,21
0,117
1,06
0,73
0,028
1,11
0,11
<0,0001
Медиана
0
0
0
0
0
0
0
0
0
Диапазон
0–2
0–3
0–2
0–3
1–2
0–6
0–6
Для каждого образца регистрировалось общее время от посева до предварительной идентификации до уровня рода или группы, окончательной идентификации и окончательного отчета о тестировании на чувствительность к противомикробным препаратам.Важно отметить, что предварительная идентификация на уровне рода может быть получена только для одной значимой культуры, помещенной в обычную среду, по сравнению с 17 культурами из хромогенной среды (данные не показаны). Сравнение времени, необходимого для окончательной идентификации уропатогенов в клинически значимых культурах, не обнаружило существенной разницы между chromID и традиционной средой (26,6 против 27,2 ч, P = 0,550). Сравнение подмножества клинически значимых культур, в которых выросли чистые E.coli показал значительное сокращение времени до окончательной идентификации E. coli с хромогенными средами по сравнению с обычными средами (24,4 ч против 27,1 ч, P = <0,0001) (). Однако не было замечено никакой разницы во времени до окончательного отчета о результатах тестирования на чувствительность к противомикробным препаратам для всех культур, включая культуры, в которых E. coli было выделено в чистой культуре (). Изоляты, выделенные в количествах, превышающих пороговое значение для значимости, за исключением CNS, Lactobacillus spp., и GBS, были подвергнуты АСТ. Результаты установки AST непосредственно из хромогенных сред сравнивали с результатами, полученными с использованием стандартных процедур, в которых среды AST были засеяны из обычного агара. Из 33 протестированных изолятов Enterobacteriaceae было обнаружено шесть незначительных ошибок, четыре основных ошибки и никаких очень серьезных ошибок, когда AST был установлен непосредственно из хромогенной среды (). Пять ошибок произошли на двух изолятах, а остальные пять — на пяти разных изолятах. Для Enterococcus spp.( n = 6), только четыре незначительные ошибки произошли при AST с chromID, состоящие из одной ошибки для ванкомицина, ципрофлоксацина и доксициклина для одного и того же изолята и одной ошибки для линезолида на другом изоляте. Не было ошибок в AST для Staphylococcus aureus ( n = 1) или Pseudomonas aeruginosa ( n = 2).
ТАБЛИЦА 3
Анализ времени до идентификации и времени до окончательного отчета для chromID и традиционных носителей a
Сравнение непрозрачной и полупрозрачной среды chromID.
Сравнение подгруппы образцов ( n = 50) было выполнено для полупрозрачной и непрозрачной среды chromID. Используя полупрозрачную среду, образцы были классифицированы как отрицательные ( n = 6), загрязненные ( n = 3), незначительные ( n = 20) и клинически значимые ( n = 21) (с ростом из E. coli [ n = 9], Enterococcus spp. [ n = 5], K. pneumoniae [ n = 3], P.mirabilis [ n = 2], P. aeruginosa [ n = 2], Enterobacter cloacae комплекс [ n = 1], Serratia marcescens [ n = 1], S aureus [ n = 1] и дрожжи [ n = 1] с четырьмя смешанными инфекциями). Интерпретация культур для двух сред показала 98% категориальное согласие, при этом один образец был классифицирован как незначительный на полупрозрачной среде и загрязненный на непрозрачной среде (данные не показаны).Кроме того, AST для подгруппы клинически значимых образцов сравнивали между прозрачной и непрозрачной средой chromID. Согласование категорий для AST для всех протестированных препаратов и изолятов было 100% между полупрозрачной и непрозрачной средами (данные не показаны).
ОБСУЖДЕНИЕ
Агар chromID CPS Elite продемонстрировал высокий уровень согласия с обычными средами для результатов культивирования и тестирования образцов мочи на чувствительность к антибиотикам. Это согласуется с предыдущими исследованиями нескольких хромогенных сред для посева мочи, показывающими, что эти среды сопоставимы с обычными средами для выделения уропатогенов (17, 19, 23, 24).Одно предыдущее исследование оценивало эффективность агара chromID CPS Elite и показало, что как непрозрачная, так и полупрозрачная среды были более чувствительны для обнаружения и идентификации уропатогенов, чем предыдущая среда CPS ID4 от того же производителя (20). Однако потенциальное влияние на клиническую лабораторию использования хромогенной среды для посева мочи, такое как использование расходных материалов, время обработки и тестирование на чувствительность к антибиотикам, в этих предыдущих исследованиях не оценивалось.
В целом, распределение уропатогенов, выделенных из образцов мочи, использованных в этом исследовании, было репрезентативным для организмов, обычно выделяемых как от осложненных, так и от неосложненных ИМП (16). Как и ожидалось, наиболее часто выделяемым уропатогеном в этом исследовании был E. coli . Расхождения были отмечены в двух образцах, в которых E. coli было идентифицировано в значительном количестве из обычного агара, тогда как хромИД классифицировал образцы как загрязненные или незначительные.От обоих образцов на хромогенном агаре отмечен рост E. coli . Однако в одном образце уровень роста был ниже порога клинической значимости. В другом образце два дополнительных типа колоний сверх порогового значения можно было выделить из отдельной морфологии колонии E. coli на хромогенной среде. Таким образом, этот образец был классифицирован как загрязненный. Вероятно, что эти колонии нельзя было дифференцировать на обычных средах, что привело к тому, что этот образец был классифицирован как клинически значимый рост E.coli . Этот результат согласуется с предыдущими исследованиями, демонстрирующими повышенную способность хромогенных сред изолировать смешанный рост уропатогенов из образцов мочи (23, 25). Это дополнительно подтверждается в нашем исследовании выделением P. mirabilis из одного образца мочи в значительных количествах с E. coli из хромогенного агара, в то время как E. coli отдельно было выделено из обычных сред.
Подавление роста нормальной периуретральной флоры с помощью среды chromID может упростить рабочий процесс в клинических микробиологических лабораториях за счет уменьшения количества образцов, классифицируемых как «клинически незначимые».Это наблюдалось в настоящем исследовании и, вероятно, способствовало значительному сокращению рабочего времени для обработки культур в целом. Напротив, ингибирование периуретральной флоры средой с хромИД также может объяснить, почему агар с хромИД не смог восстановить количества, превышающие пороговое значение Lactobacillus spp. в трех экземплярах и ГБС с одного экземпляра. Кроме того, хромогенные среды не смогли выделить GBS в любом количестве из пяти образцов, в которых GBS был отмечен на обычных средах.В предыдущих исследованиях сообщалось о несоответствиях в способности хромогенных сред точно идентифицировать GBS по образцам мочи (17, 23). Это может быть проблемой для лабораторий, которые сообщают о любом количестве бактериурии с GBS в образцах, полученных от женщин детородного возраста, и это следует учитывать, если эта среда используется отдельно для посева образцов мочи.
В то время как в предыдущем исследовании анализировалось время обработки хромогенного агара chromID CPS4, сравнение времени обработки для стандартной среды не проводилось из-за различий в протоколе (19).В других исследованиях сообщалось о сокращении времени обработки посева мочи с хромогенными средами (23, 26). Однако оценка сэкономленного времени основывалась на экстраполяции практического времени для всех культур на основе заранее определенного среднего времени обработки или ретроспективного анализа временных меток, полученных из лабораторной информационной системы. В последнее время в лабораториях клинической микробиологии резко изменились лабораторные рабочие процессы и требования к персоналу (3, 27). В настоящем исследовании каждый этап обработки каждого отдельного образца выполнялся одним технологом и записывался с помощью секундомера, чтобы конкретно и объективно оценить разницу во времени работы между хромогенными и традиционными средами.Мы наблюдали вариабельность практического времени между образцами в зависимости от количества и типа роста организмов, что подтверждает, что использование расчетного времени обработки для каждой культуры не может быть широко применимо ко всем образцам мочи.
Мы обнаружили, что время практической работы с культурами E. coli с использованием chromID было уменьшено в среднем более чем на 1 минуту на образец, что может быть связано со способностью непосредственно идентифицировать E. coli с помощью chromID на основа внешнего вида колонии без необходимости окрашивания по Граму или биохимического анализа.Поскольку E. coli представляют собой подавляющее большинство положительных культур мочи, это может существенно изменить время обработки для лабораторий клинической микробиологии. Уменьшение количества зараженных и несущественных культур с chromID, вероятно, способствовало значительному сокращению времени, необходимого для обработки хромогенных сред для всех культур по сравнению с обычными средами. Кроме того, значительное сокращение использования расходных материалов, быстрых биохимических тестов и необходимость MALDI-TOF MS для идентификации организмов, вероятно, добавили к сокращению времени практического применения, показанному для всех клинически значимых культур.Используя данные, собранные в этом исследовании, в среднем 21 секунду практического времени, сэкономленного на культуру с хромид-агаром, гипотетическая лаборатория, обрабатывающая 50000 посевов мочи в год, сэкономила бы почти 292 часа, или 36,5 рабочих дней (т. Е. 8 часов дней), практического времени обработки ежегодно. При ориентировочной стоимости в 5 долларов за одну чашку с агаром с chromID по сравнению с примерно 0,50 долларов за каждую чашку с кровяным агаром и агаром МакКонки, эта теоретическая лаборатория будет тратить дополнительно 200000 долларов в год на среды для культивирования мочи.Данные этого исследования показывают, что экономия расходных материалов и рабочего времени может частично компенсировать рост затрат. Возможная дополнительная экономия может быть достигнута за счет последующего воздействия на уход за пациентами или продолжительность пребывания в больнице, хотя в этом исследовании не рассматриваются исходы для пациентов. Кроме того, эти затраты представляют собой только оценки, которые не принимают во внимание региональные различия в ценах и различия в контрактах на закупку с учреждениями.
Среда chromID позволяет предварительно идентифицировать несколько микроорганизмов до уровня рода или группы на основе окраски по Граму и внешнего вида колоний.Такая быстрая идентификация может быть полезной, поскольку она может ускорить получение результатов и уменьшить неопределенность при выборе подходящей антибактериальной терапии, особенно для стационарных пациентов со сложными ИМП, для которых лечение может быть своевременно изменено. Примечательно, что предварительная идентификация на уровне рода или группы в этом исследовании произошла для 17 образцов, помещенных на хромID, в то время как только один образец из традиционной среды удалось предварительно идентифицировать. Из-за возможности напрямую идентифицировать E.coli из хромогенных сред, время до окончательной идентификации E. coli было значительно сокращено по сравнению с обычными средами. Однако не было отмечено различий во времени до окончательной идентификации других уропатогенов из-за необходимости окрашивания по Граму и дальнейшего тестирования для окончательной идентификации на обоих типах сред. Кроме того, не было измерено никаких существенных различий за время до окончательного отчета по какой-либо культуре. Это согласуется с предыдущим отчетом, в котором не было продемонстрировано значительной разницы во времени оборота между до и после введения ориентировочной среды CHROMagar для идентификации уропатогенов в лаборатории клинической микробиологии (26).
Хромогенные среды не одобрены FDA для проведения MALDI-TOF MS или тестирования антимикробной чувствительности непосредственно без пересева на обычные среды; это может задержать получение результатов примерно на 1 день. Анализ чувствительности, проведенный с помощью chromID, продемонстрировал точные результаты, без каких-либо серьезных ошибок, связанных с хромогенным агаром; это согласуется с предыдущим исследованием более ранней итерации среды chromID, агара chromID CPS3, в котором была установлена достоверность AST непосредственно из этой среды (24).Кроме того, идентификация MALDI-TOF MS была успешно и точно выполнена непосредственно с агара chromID.
Хотя подробный анализ, проведенный в этом исследовании, является сильной стороной этого исследования, он не лишен ограничений. Это одноцентровое исследование с ограниченным размером выборки. Кроме того, вполне вероятно, что более значительные различия будут наблюдаться в отношении времени и времени на идентификацию для лабораторий, которые полагаются на обычные биохимические методы, а не на MALDI-TOF MS для идентификации бактерий.Поскольку для анализа использовались деидентифицированные образцы, корреляция результатов посева с клинической картиной или анализом мочи была невозможна. Наконец, в этом наборе образцов отсутствовали уропатогены, которые могут быть важными причинами ИМП, такие как Staphylococcus saprophyticus , Aerococcus urinae и Corynebacterium urealyticum . Таким образом, эффективность этой среды для этих организмов не могла быть оценена.
Это исследование демонстрирует, что характеристики среды chromID сравнимы с характеристиками обычных сред в сочетании с идентификацией MALDI-TOF MS для наиболее распространенных уропатогенов.Практическое время и расходные материалы были сокращены с использованием chromID по сравнению с обычными средами для клинически значимых культур, особенно культур E. coli . Это преимущество может компенсировать повышенную стоимость хромогенных сред по сравнению со стандартными питательными средами (24, 26, 28). В то время как появляющиеся и необычные уропатогены, вероятно, потребуют традиционных методов идентификации, агар chromID CPS Elite может быть реальной альтернативой обычным средам для выделения и идентификации наиболее распространенных уропатогенов в образцах мочи.
Посев образцов мочи с использованием элитной среды chromID CPS может ускорить идентификацию кишечной палочки и сократить время работы в клинической лаборатории
Реферат
Моча — один из наиболее распространенных типов образцов, отправляемых в лабораторию клинической микробиологии; Использование хромогенного агара — это один из методов, с помощью которого лаборатория может ускорить получение результатов посева и сократить время работы и материалы, необходимые для анализа посева мочи. Целью нашего исследования было сравнение хромогенной среды chromID CPS Elite (bioMérieux) с обычной первичной культуральной средой для оценки образцов мочи.Остаточные образцы мочи ( n = 200) инокулировали в обычные среды и в агар chromID CPS Elite (chromID). Время идентификации и использованные расходные материалы были задокументированы для обоих методов. Клинически значимый патоген (ы) был выделен из 51 культуры с использованием обычных сред, из которых Escherichia coli были наиболее часто выздоровевшими организмами ( n = 22). Степень точного совпадения уропатогенов между традиционной и хромогенной средами составила 82%, в то время как общее категориальное совпадение было 83.5%. Временной интервал между посевом и окончательной идентификацией микроорганизмов был уменьшен с помощью хромированного агара по сравнению с обычной средой для E. coli (в среднем 24,4 часа по сравнению с 27,1 часа, P <0,001). Используя chromID, клинически значимые культуры требовали меньше времени на обработку одной культуры (в среднем 1 мин и 2 с [1:02 мин]) по сравнению с обычными средами (в среднем 1:31 мин). Кроме того, для использования chromID потребовалось меньше расходных материалов (2,4 против 3,3 палочек и тампонов) и быстрые биохимические тесты (1,0 против 1,9) по сравнению с обычными средами.Примечательно, что тестирование на чувствительность к противомикробным препаратам продемонстрировало хорошее общее согласие (97,4%) между chromID и обычными средами для всех протестированных антибиотиков. chromID CPS Elite обеспечивает точную идентификацию уропатогенов, снижает расход расходных материалов и может ускорить идентификацию E. coli в клинических образцах.
ВВЕДЕНИЕ
Инфекции мочевыводящих путей (ИМП) являются одними из самых распространенных бактериальных инфекций во всем мире (1). Скрининг посевов мочи для выявления значимых уропатогенов может потребовать значительного времени, использования расходных материалов и биохимических тестов.В результате посевы мочи для подтверждения диагноза ИМП составляют основную часть рабочей нагрузки микробиологических лабораторий (2), которые сталкиваются с нехваткой квалифицированного лабораторного персонала (3). Таким образом, существует потребность в точных методах, позволяющих сэкономить время и снизить рабочую нагрузку. Кроме того, все большее внимание уделяется ускорению получения результатов посева от пациентов с инфекцией; минимизация окна диагностической неопределенности имеет важное значение для оптимизации противомикробной терапии и улучшения результатов лечения пациентов (4).
Одним из подходов к рационализации посева мочи является быстрая идентификация организмов, выросших на твердом агаре, с использованием матричной лазерной десорбционной ионизации, времяпролетной масс-спектрометрии (MALDI-TOF MS). Было показано, что этот метод является точным и экономичным для идентификации бактериальных и грибковых организмов (5, –15). Однако до MALDI-TOF MS может потребоваться значительное время для выделения значительных уропатогенов из стандартной среды, особенно для пациентов со смешанными инфекциями.
Большинство осложненных и неосложненных ИМП вызывается Escherichia coli и другими микроорганизмами, такими как Klebsiella pneumoniae , Staphylococcus saprophyticus , Enterococcus spp. И стрептококками группы B, вносящими значительный вклад в стрептококки группы B (GBS). часть эпидемиологии ИМП (16). Поскольку этиология большинства ИМП ограничивается несколькими микроорганизмами, культивирование уропатогенов можно использовать с использованием хромогенного агара, что может минимизировать время обработки и необходимые расходные материалы.В нескольких исследованиях оценивали коммерчески доступные хромогенные агары для идентификации распространенных уропатогенов (17, –20). Недавно выпущенный в продажу хромогенный агар, агар chromID CPS Elite (chromID) (bioMérieux, Дарем, Северная Каролина), облегчает выделение и идентификацию нескольких распространенных возбудителей ИМП по характеристикам их колоний. Основным преимуществом этой среды является способность непосредственно идентифицировать E. coli . В сочетании с окрашиванием по Граму среда chromID также позволяет предположительно идентифицировать Enterococcus spp., некоторые представители группы Enterobacteriaceae и представители группы Proteeae ( Proteus , Providencia и Morganella ). Для этих организмов окончательная идентификация требует биохимического тестирования или анализа MALDI-TOF MS. Целью нашего исследования было сравнить эффективность chromID с использованием обычных сред для первичной культивирования образцов мочи. Для каждого типа среды оценивалась точность обнаружения уропатогенов, время работы, использование расходных материалов и время, необходимое для идентификации.Кроме того, была оценена точность теста на чувствительность к противомикробным препаратам, проведенного непосредственно с хромогенного агара, и проведено сравнение со стандартными средами.
(Это исследование было частично представлено в виде стендовой презентации [плакат Friday-330] в ASM Microbe, Бостон, Массачусетс, июнь 2016 г.)
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
Субъекты.
После получения одобрения Наблюдательного совета Вашингтонского университета 200 деидентифицированных образцов остаточной мочи были отправлены в микробиологическую лабораторию больницы Барнс-Еврей (Св.Луи, Миссури) в рамках рутинной клинической помощи были случайным образом выбраны для включения в это исследование. Двадцать образцов в неделю оценивали в течение 10 недель. Для включения в исследование образцы должны были быть обработаны в течение 24 часов после сбора и отправлены в транспортные пробирки BD с серым верхом для культивирования мочи. Были собраны основные демографические данные субъектов, включая пол, возраст, больничное отделение и статус стационарного пациента.
Методы культивирования.
Мочу высевали с использованием калиброванной петли для посева на 1 мкл с поперечной полосой на обычную кровь и агар МакКонки (Харди, Санта-Мария, Калифорния) и на хромогенный агар chromID CPS Elite (bioMérieux).Планшеты устанавливали и инкубировали партиями по пять штук, разделенных 30 минутами каждая, чтобы обеспечить точное время последующего рабочего процесса. Культуры инкубировали от 22 до 24 ч при 35 ° C на воздухе. Контроль качества хромИД проводился согласно рекомендациям производителя.
Идентификация микроорганизмов и тестирование на чувствительность к противомикробным препаратам.
Обычные среды и среды chromID считывались и интерпретировались в соответствии с критериями стандартной рабочей процедуры для посева мочи в лаборатории клинической микробиологии.Рост одного или двух отдельных организмов при пороге 50 000 КОЕ / мл был классифицирован как клинически значимый рост. Присутствие трех или более организмов, количество каждого из которых превышает пороговое значение, было классифицировано как зараженное. Все исследования клинически значимых организмов выполнялись в соответствии с вкладышем в упаковку для среды chromID. Клинически значимые организмы были идентифицированы с помощью Vitek MS v2.0 (bioMérieux) непосредственно из обычных или хромированных сред (11, –13, 15). На каждом этапе обследования и идентификации с помощью секундомера документировалось время работы и расходные материалы как для обычных, так и для хромогенных методов.
Тестирование чувствительности к антибиотикам (AST), если указано, проводилось непосредственно вне рутинной среды или среды chromID с использованием дисковой диффузии Кирби-Бауэра в соответствии с лабораторным протоколом для данного типа организма. При необходимости для анализа противоречий регистрировались размеры зон. AST и интерпретация результатов выполнялись в соответствии с рекомендациями Института клинических и лабораторных стандартов (CLSI) (21, 22). Все препараты оценивались на соответствие категории, и любые ошибки классифицировались.
Сравнение непрозрачных и полупрозрачных сред chromID CPS.
Среда chromID доступна в полупрозрачном или непрозрачном формате, которые идентичны по составу, за исключением непрозрачности среды. Для сравнения полупрозрачного или непрозрачного агара chromID CPS Elite случайным образом была отобрана подгруппа из 50 растущих образцов, которые культивировали одновременно как со средой chromID CPS Elite, так и со средой chromID CPS Elite OPAQUE с использованием 1-мкл петли. Идентификацию и количественную оценку организмов проводили для каждого типа среды и сравнивали.Для сравнения AST культуры с клинически значимым ростом тестировали непосредственно из сред chromID CPS Elite и chromID CPS Elite OPAQUE. Согласие AST было проанализировано по соглашению категорий, как описано выше.
Статистический анализ.
По завершении сравнения был проведен статистический анализ для определения точности и оценки различий во времени работы, времени представления результатов и использованных материалах. Для точности категориальное соответствие каждой культуры и точное соответствие группе или видовому уровню каждого изолята сравнивали между chromID и обычными средами.Категорическое согласие было определено как одна и та же классификация (клинически значимая, загрязненная, клинически незначимая или отсутствие роста) между стандартной и хромогенной средами для одного и того же образца. Двусторонние тесты t (парные и непарные, в зависимости от каждого сравнения) использовались для сравнения различий во времени работы, времени до представления результатов и использованных материалах. Все анализы были выполнены с использованием SAS / STAT версии 9.1 системы SAS.
РЕЗУЛЬТАТЫ
Темы.
Всего было оценено 200 деидентифицированных образцов остатков, которые были отправлены для посева мочи. Эти образцы были собраны у субъектов в возрасте от 14 до 100 лет (в среднем 52 года; в среднем 54 года), причем 60% субъектов составляли женщины. В общей сложности 45% образцов были собраны в стационарах.
Точность chromID CPS.
Образцы мочи помещали на агар с хромидом, и рост сравнивали с традиционной средой в качестве стандартного метода сравнения.Из 200 культур 61 была классифицирована на обычных средах как не имеющие роста, 72 продемонстрировали клинически незначительный рост и 16 были загрязнены на обычном агаре (). По сравнению с обычными средами, меньшее количество образцов было классифицировано как загрязненные ( n = 12) или клинически незначимые ( n = 62) с помощью хромид-агара, что привело к категориальному положительному совпадению 68,8 и 73,6%, соответственно, между двумя методами. . В целом, клинически значимые патогены были выделены из 51 культуры с E.coli как наиболее часто выздоравливающий организм ( n = 22). Члены групп Enterobacteriaceae и Proteeae представляли 11 и 2 особи соответственно. Грамположительные организмы, выделенные в значительных количествах из обычных сред, включали Enterococcus spp. ( n = 6) и Staphylococcus spp. ( п = 2). Смешанные инфекции были выявлены в семи значимых культурах. Из 51 клинически значимой культуры chromID классифицировал 45 как значимые (88.2% положительное категориальное согласие) (). При рассмотрении исключительно уропатогенов степень точного соответствия между обычными и хромогенными средами составила 82%, а общее категориальное согласие составило 83,5%. Хотя Vitek MS не был одобрен Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США (FDA) для тестирования непосредственно с хромогенной среды, результаты тестирования MALDI-TOF MS с этой средой совпадают с результатами тестирования с использованием крови или агара МакКонки.
ТАБЛИЦА 1
Категориальное соответствие между обычными средами и носителями chromID
Категория
No.положительных результатов
% категориальное согласие
Оба метода
Только традиционные
Только хромогенные
Клинически значимые
45
6
90ram отрицательные
Escherichia coli
20
2
0
Другие Enterobacteriaceae7 9013 9013 9013 9013 9013 9013 Enterobacteriaceae7 Proteeae
2
0
1
Pseudomonas aeruginosa
2
0
0
грамм
Enterococcus spp.
6
0
0
Staphylococcus spp.
1
1
0
Стрептококк группы B a
0
1
0
9135
Lactobac
0
3
0
Другие грамположительные бактерии
2
0
0
Дрожжи
Всего
51
7
1
Клинически незначимо
53
19
9
74
906 11 5
Отсутствие роста
58
3
23
95
Из несоответствий между обычным и хромогенным агаром, организмы, которые не были выделены в клинически значимых количествах на chromID, включали стрептококки группы B (GBS; n = 1), Lactobacillus ( n = 3), E.coli ( n = 2) и коагулазонегативные стафилококки (ЦНС; n = 1). В одном образце со смешанной инфекцией Proteus mirabilis был выделен из chromID, но не из обычных сред. Примечательно, что GBS был выделен из пяти образцов, классифицированных как незначительные или загрязненные на обычных средах, но не был выделен ни в каком количестве из соответствующей культуры на хромогенных средах.
Анализ рабочего времени и расходных материалов.
Время обработки каждого образца и количество расходных материалов, быстрые биохимические тесты (каталаза, оксидаза и индол) и планшеты для пересева, необходимые для идентификации, регистрировались для каждого типа среды.Время, необходимое для обработки образцов на хромогенных средах (среднее, 1:02 [мин: с]; диапазон, 0: 05–3: 16), было значительно меньше для клинически значимых культур по сравнению с обычными средами ( среднее 1:31; диапазон 0: 40–4: 41) ( P = 0,003) (). Из клинически значимых образцов для агара chromID потребовалось меньше быстрых биохимических тестов (в среднем 1,04 против 1,92) и меньше анализа MALDI-TOF MS для идентификации (в среднем 0,73 против 1,06) по сравнению с обычными средами ().Большинство этих различий было связано с культурами чистой E. coli , у которых было значительно меньшее время практической работы (в среднем 0:20 по сравнению с 1:24 м: сс), использование расходных материалов (среднее 0,33 против 3,33) и быстрые биохимические анализы (среднее 0,22 против 2,22) и необходимость идентификации MALDI-TOF MS (среднее 0,11 против 1,11) по сравнению с обычными средами. Не было обнаружено значительных различий в необходимости окрашивания по Граму или пересева для любой категории посева мочи ().
ТАБЛИЦА 2
Оценка практического времени и расходных материалов для хромИДа по сравнению с обычными средами
Параметр
Все культуры
Клинически значимые
Культуры с E.coli
Обычный ( n = 200)
chromID ( n = 200)
P
Обычный ( n = 51)
chromID ( n = 45)
P
Обычный ( n = 18)
chromID ( n = 18)
P
Время работы вручную (мин: с)
Среднее значение
0:45
0:24
0.029
1:31
1:02
0,003
1:24
0:20
<0,0001
Медиана
0:13
0:06
37
37
1:11
1:19
0:10
Диапазон
0: 03–30: 08
0: 02–3: 16
0: 40– 4:41
0: 05–3: 16
0: 57–2: 10
0: 05–1: 59
Использованные расходные материалы a ( n )
Среднее
0.99
0,68
0,052
3,33
2,44
0,029
3,33
0,33
<0,0001
Медиана 3
0
0
0
0
0
0
Диапазон
0–8
0–9
1–8
0–9
3–6
0–6
0–6
Пятна по Граму ( n )
Среднее
0.12
0,16
0,373
0,37
0,62
0,053
0,11
0,00
0,163
Медиана
0
0
0
0
0
Диапазон
0–2
0–2
0–1
0–2
0–1
0
b ( n )
Среднее
0.59
0,29
0,0005
1,92
1,04
<0,0001
2,22
0,22
<0,0001
Медиана
0
0
0
2
0
Диапазон
0–4
0–4
0–4
0–4
2–4
0–2
Планшеты для субкультуры ( n )
Среднее
0.01
0,03
0,203
0,04
0,09
0,41
0,00
0,06
0,331
медиана
0
0
0
0
0
Диапазон
0–1
0–2
0–1
0–2
0
0–1
M ( n )
Среднее
0.30
0,21
0,117
1,06
0,73
0,028
1,11
0,11
<0,0001
Медиана
0
0
0
0
0
0
0
0
0
Диапазон
0–2
0–3
0–2
0–3
1–2
0–6
0–6
Для каждого образца регистрировалось общее время от посева до предварительной идентификации до уровня рода или группы, окончательной идентификации и окончательного отчета о тестировании на чувствительность к противомикробным препаратам.Важно отметить, что предварительная идентификация на уровне рода может быть получена только для одной значимой культуры, помещенной в обычную среду, по сравнению с 17 культурами из хромогенной среды (данные не показаны). Сравнение времени, необходимого для окончательной идентификации уропатогенов в клинически значимых культурах, не обнаружило существенной разницы между chromID и традиционной средой (26,6 против 27,2 ч, P = 0,550). Сравнение подмножества клинически значимых культур, в которых выросли чистые E.coli показал значительное сокращение времени до окончательной идентификации E. coli с хромогенными средами по сравнению с обычными средами (24,4 ч против 27,1 ч, P = <0,0001) (). Однако не было замечено никакой разницы во времени до окончательного отчета о результатах тестирования на чувствительность к противомикробным препаратам для всех культур, включая культуры, в которых E. coli было выделено в чистой культуре (). Изоляты, выделенные в количествах, превышающих пороговое значение для значимости, за исключением CNS, Lactobacillus spp., и GBS, были подвергнуты АСТ. Результаты установки AST непосредственно из хромогенных сред сравнивали с результатами, полученными с использованием стандартных процедур, в которых среды AST были засеяны из обычного агара. Из 33 протестированных изолятов Enterobacteriaceae было обнаружено шесть незначительных ошибок, четыре основных ошибки и никаких очень серьезных ошибок, когда AST был установлен непосредственно из хромогенной среды (). Пять ошибок произошли на двух изолятах, а остальные пять — на пяти разных изолятах. Для Enterococcus spp.( n = 6), только четыре незначительные ошибки произошли при AST с chromID, состоящие из одной ошибки для ванкомицина, ципрофлоксацина и доксициклина для одного и того же изолята и одной ошибки для линезолида на другом изоляте. Не было ошибок в AST для Staphylococcus aureus ( n = 1) или Pseudomonas aeruginosa ( n = 2).
ТАБЛИЦА 3
Анализ времени до идентификации и времени до окончательного отчета для chromID и традиционных носителей a
Сравнение непрозрачной и полупрозрачной среды chromID.
Сравнение подгруппы образцов ( n = 50) было выполнено для полупрозрачной и непрозрачной среды chromID. Используя полупрозрачную среду, образцы были классифицированы как отрицательные ( n = 6), загрязненные ( n = 3), незначительные ( n = 20) и клинически значимые ( n = 21) (с ростом из E. coli [ n = 9], Enterococcus spp. [ n = 5], K. pneumoniae [ n = 3], P.mirabilis [ n = 2], P. aeruginosa [ n = 2], Enterobacter cloacae комплекс [ n = 1], Serratia marcescens [ n = 1], S aureus [ n = 1] и дрожжи [ n = 1] с четырьмя смешанными инфекциями). Интерпретация культур для двух сред показала 98% категориальное согласие, при этом один образец был классифицирован как незначительный на полупрозрачной среде и загрязненный на непрозрачной среде (данные не показаны).Кроме того, AST для подгруппы клинически значимых образцов сравнивали между прозрачной и непрозрачной средой chromID. Согласование категорий для AST для всех протестированных препаратов и изолятов было 100% между полупрозрачной и непрозрачной средами (данные не показаны).
ОБСУЖДЕНИЕ
Агар chromID CPS Elite продемонстрировал высокий уровень согласия с обычными средами для результатов культивирования и тестирования образцов мочи на чувствительность к антибиотикам. Это согласуется с предыдущими исследованиями нескольких хромогенных сред для посева мочи, показывающими, что эти среды сопоставимы с обычными средами для выделения уропатогенов (17, 19, 23, 24).Одно предыдущее исследование оценивало эффективность агара chromID CPS Elite и показало, что как непрозрачная, так и полупрозрачная среды были более чувствительны для обнаружения и идентификации уропатогенов, чем предыдущая среда CPS ID4 от того же производителя (20). Однако потенциальное влияние на клиническую лабораторию использования хромогенной среды для посева мочи, такое как использование расходных материалов, время обработки и тестирование на чувствительность к антибиотикам, в этих предыдущих исследованиях не оценивалось.
В целом, распределение уропатогенов, выделенных из образцов мочи, использованных в этом исследовании, было репрезентативным для организмов, обычно выделяемых как от осложненных, так и от неосложненных ИМП (16). Как и ожидалось, наиболее часто выделяемым уропатогеном в этом исследовании был E. coli . Расхождения были отмечены в двух образцах, в которых E. coli было идентифицировано в значительном количестве из обычного агара, тогда как хромИД классифицировал образцы как загрязненные или незначительные.От обоих образцов на хромогенном агаре отмечен рост E. coli . Однако в одном образце уровень роста был ниже порога клинической значимости. В другом образце два дополнительных типа колоний сверх порогового значения можно было выделить из отдельной морфологии колонии E. coli на хромогенной среде. Таким образом, этот образец был классифицирован как загрязненный. Вероятно, что эти колонии нельзя было дифференцировать на обычных средах, что привело к тому, что этот образец был классифицирован как клинически значимый рост E.coli . Этот результат согласуется с предыдущими исследованиями, демонстрирующими повышенную способность хромогенных сред изолировать смешанный рост уропатогенов из образцов мочи (23, 25). Это дополнительно подтверждается в нашем исследовании выделением P. mirabilis из одного образца мочи в значительных количествах с E. coli из хромогенного агара, в то время как E. coli отдельно было выделено из обычных сред.
Подавление роста нормальной периуретральной флоры с помощью среды chromID может упростить рабочий процесс в клинических микробиологических лабораториях за счет уменьшения количества образцов, классифицируемых как «клинически незначимые».Это наблюдалось в настоящем исследовании и, вероятно, способствовало значительному сокращению рабочего времени для обработки культур в целом. Напротив, ингибирование периуретральной флоры средой с хромИД также может объяснить, почему агар с хромИД не смог восстановить количества, превышающие пороговое значение Lactobacillus spp. в трех экземплярах и ГБС с одного экземпляра. Кроме того, хромогенные среды не смогли выделить GBS в любом количестве из пяти образцов, в которых GBS был отмечен на обычных средах.В предыдущих исследованиях сообщалось о несоответствиях в способности хромогенных сред точно идентифицировать GBS по образцам мочи (17, 23). Это может быть проблемой для лабораторий, которые сообщают о любом количестве бактериурии с GBS в образцах, полученных от женщин детородного возраста, и это следует учитывать, если эта среда используется отдельно для посева образцов мочи.
В то время как в предыдущем исследовании анализировалось время обработки хромогенного агара chromID CPS4, сравнение времени обработки для стандартной среды не проводилось из-за различий в протоколе (19).В других исследованиях сообщалось о сокращении времени обработки посева мочи с хромогенными средами (23, 26). Однако оценка сэкономленного времени основывалась на экстраполяции практического времени для всех культур на основе заранее определенного среднего времени обработки или ретроспективного анализа временных меток, полученных из лабораторной информационной системы. В последнее время в лабораториях клинической микробиологии резко изменились лабораторные рабочие процессы и требования к персоналу (3, 27). В настоящем исследовании каждый этап обработки каждого отдельного образца выполнялся одним технологом и записывался с помощью секундомера, чтобы конкретно и объективно оценить разницу во времени работы между хромогенными и традиционными средами.Мы наблюдали вариабельность практического времени между образцами в зависимости от количества и типа роста организмов, что подтверждает, что использование расчетного времени обработки для каждой культуры не может быть широко применимо ко всем образцам мочи.
Мы обнаружили, что время практической работы с культурами E. coli с использованием chromID было уменьшено в среднем более чем на 1 минуту на образец, что может быть связано со способностью непосредственно идентифицировать E. coli с помощью chromID на основа внешнего вида колонии без необходимости окрашивания по Граму или биохимического анализа.Поскольку E. coli представляют собой подавляющее большинство положительных культур мочи, это может существенно изменить время обработки для лабораторий клинической микробиологии. Уменьшение количества зараженных и несущественных культур с chromID, вероятно, способствовало значительному сокращению времени, необходимого для обработки хромогенных сред для всех культур по сравнению с обычными средами. Кроме того, значительное сокращение использования расходных материалов, быстрых биохимических тестов и необходимость MALDI-TOF MS для идентификации организмов, вероятно, добавили к сокращению времени практического применения, показанному для всех клинически значимых культур.Используя данные, собранные в этом исследовании, в среднем 21 секунду практического времени, сэкономленного на культуру с хромид-агаром, гипотетическая лаборатория, обрабатывающая 50000 посевов мочи в год, сэкономила бы почти 292 часа, или 36,5 рабочих дней (т. Е. 8 часов дней), практического времени обработки ежегодно. При ориентировочной стоимости в 5 долларов за одну чашку с агаром с chromID по сравнению с примерно 0,50 долларов за каждую чашку с кровяным агаром и агаром МакКонки, эта теоретическая лаборатория будет тратить дополнительно 200000 долларов в год на среды для культивирования мочи.Данные этого исследования показывают, что экономия расходных материалов и рабочего времени может частично компенсировать рост затрат. Возможная дополнительная экономия может быть достигнута за счет последующего воздействия на уход за пациентами или продолжительность пребывания в больнице, хотя в этом исследовании не рассматриваются исходы для пациентов. Кроме того, эти затраты представляют собой только оценки, которые не принимают во внимание региональные различия в ценах и различия в контрактах на закупку с учреждениями.
Среда chromID позволяет предварительно идентифицировать несколько микроорганизмов до уровня рода или группы на основе окраски по Граму и внешнего вида колоний.Такая быстрая идентификация может быть полезной, поскольку она может ускорить получение результатов и уменьшить неопределенность при выборе подходящей антибактериальной терапии, особенно для стационарных пациентов со сложными ИМП, для которых лечение может быть своевременно изменено. Примечательно, что предварительная идентификация на уровне рода или группы в этом исследовании произошла для 17 образцов, помещенных на хромID, в то время как только один образец из традиционной среды удалось предварительно идентифицировать. Из-за возможности напрямую идентифицировать E.coli из хромогенных сред, время до окончательной идентификации E. coli было значительно сокращено по сравнению с обычными средами. Однако не было отмечено различий во времени до окончательной идентификации других уропатогенов из-за необходимости окрашивания по Граму и дальнейшего тестирования для окончательной идентификации на обоих типах сред. Кроме того, не было измерено никаких существенных различий за время до окончательного отчета по какой-либо культуре. Это согласуется с предыдущим отчетом, в котором не было продемонстрировано значительной разницы во времени оборота между до и после введения ориентировочной среды CHROMagar для идентификации уропатогенов в лаборатории клинической микробиологии (26).
Хромогенные среды не одобрены FDA для проведения MALDI-TOF MS или тестирования антимикробной чувствительности непосредственно без пересева на обычные среды; это может задержать получение результатов примерно на 1 день. Анализ чувствительности, проведенный с помощью chromID, продемонстрировал точные результаты, без каких-либо серьезных ошибок, связанных с хромогенным агаром; это согласуется с предыдущим исследованием более ранней итерации среды chromID, агара chromID CPS3, в котором была установлена достоверность AST непосредственно из этой среды (24).Кроме того, идентификация MALDI-TOF MS была успешно и точно выполнена непосредственно с агара chromID.
Хотя подробный анализ, проведенный в этом исследовании, является сильной стороной этого исследования, он не лишен ограничений. Это одноцентровое исследование с ограниченным размером выборки. Кроме того, вполне вероятно, что более значительные различия будут наблюдаться в отношении времени и времени на идентификацию для лабораторий, которые полагаются на обычные биохимические методы, а не на MALDI-TOF MS для идентификации бактерий.Поскольку для анализа использовались деидентифицированные образцы, корреляция результатов посева с клинической картиной или анализом мочи была невозможна. Наконец, в этом наборе образцов отсутствовали уропатогены, которые могут быть важными причинами ИМП, такие как Staphylococcus saprophyticus , Aerococcus urinae и Corynebacterium urealyticum . Таким образом, эффективность этой среды для этих организмов не могла быть оценена.
Это исследование демонстрирует, что характеристики среды chromID сравнимы с характеристиками обычных сред в сочетании с идентификацией MALDI-TOF MS для наиболее распространенных уропатогенов.Практическое время и расходные материалы были сокращены с использованием chromID по сравнению с обычными средами для клинически значимых культур, особенно культур E. coli . Это преимущество может компенсировать повышенную стоимость хромогенных сред по сравнению со стандартными питательными средами (24, 26, 28). В то время как появляющиеся и необычные уропатогены, вероятно, потребуют традиционных методов идентификации, агар chromID CPS Elite может быть реальной альтернативой обычным средам для выделения и идентификации наиболее распространенных уропатогенов в образцах мочи.
Подробная информация о IIS 10.0 — 404.11
Ошибка HTTP 404.11 — не найдено
O módulo de filtragem de solicitação está configurado para negar uma solicitação que contenha uma sequência de saída dupla.
Causas mais prováveis:
Непрерывное обращение с запросом на дублирование, а также фильтрация запроса с конфигурацией веб-сервера, не содержащего повторных сообщений.
Ações que você pode tentar:
Проверьте конфигурацию / систему.webServer / security / requestFiltering @ allowDoubleEscaping без arquivo applicationhost.config или web.confg.
Este é um recurso de segurança.Não o altere, menos que o escopo da alteração seja totalmente compreendido. Você deve fazer um rastreamento de rede antes de alterar esse valor, para confirmar se a solicitação não é mal-intencionada. Для того, чтобы продолжить работу сервера, измените конфигурацию configuration/system.webServer/security/requestFiltering@allowDoubleEscaping. Причина, по которой URL-адрес неверно сформирован, на сервере, используемом для неправильного намерения.
Visualizar mais informações »
% PDF-1.5
%
85 0 объект
>
эндобдж xref
85 22
0000000017 00000 н.
0000001476 00000 н.
0000001566 00000 н.
0000001713 00000 н.
0000001994 00000 н.
0000002313 00000 н.
0000002380 00000 н.
0000002425 00000 н.
0000002964 00000 н.
0000003005 00000 н.
0000003133 00000 п.
0000003229 00000 н.
0000003688 00000 н.
0000003790 00000 н.
0000003933 00000 н.
0000004177 00000 н.
0000004779 00000 н.
0000005147 00000 н.
0000006294 00000 н.
0000014396 00000 п.
0000016020 00000 н.
0000022152 00000 п.
трейлер
>
/ Фильтр [/ FlateDecode]
/Я БЫ [
]
/ Инфо 84 0 R
/ Назад 154881
/ Корень 86 0 R
/ Размер 107
/ Источник (WeJXFxNO4fJduyUMetTcP9 + oaONfINN4 + d7v87LgX2wZ4VKxYW3Yfe0UG0cxzgJPB9khgm8VtCFmyd8gIrwOjQRAIjPsWhM4vgMCV \
8KvVF / K8lf75fcdd7vGe0iYWXc1DZgsCst + wRQ3GEg =)
/ Вт [1 3 1]
>>
startxref
0
%% EOF 86 0 объект
>
эндобдж 87 0 объект
>
/ Шрифт>
>>
/ Поля []
>>
эндобдж 88 0 объект
>
транслировать
х =
@FAM
A»E-ӊ`% A, -o`c
beY3; + ɕR? ظ cq-4 WR (5YfJmEr + k ZNҋ) U3 / t Cj 9? qnW5dlР7; pzf
7 {XC7
конечный поток
эндобдж 89 0 объект
>
/ ExtGState>
/ Шрифт>
/ Свойства>
/ Затенение>
/ XObject>
>>
/ Тип / Страница
>>
эндобдж 90 0 объект
>
эндобдж 91 0 объект
>
эндобдж 92 0 объект
>
эндобдж 93 0 объект
[/ ICCBased
106 0 R]
эндобдж 94 0 объект
>
эндобдж 95 0 объект
>
эндобдж 96 0 объект
>
транслировать
x] ۊ 0 @ ylL «ۂ {aVǮF ߙ ta2S3A ^
N: xw} uI7Uoxob] մ o Օ
(: vmz: qr ^ k] kz _:>; u * Re: iv79cDkBW; 4 ‘酞 LocI5wT] (84i! up $ f5M $ # f1c $ kx3a3_ & ΙO’yR `7`77`77`77`77 `7` / i
.
Перед измельчением породы тщательно высушивают до нормального рабочего состояния (до 10-12%).
Такие изделия хорошо работают на изгиб. Их легкость, гибкость и пористость позволяют использовать в качестве эффективного утеплителя.
Так можно достичь оптимальный уровень комфорта внутри здания, если не требуется усиленное утепление. 
Они дополнительно изолируют внутреннее тепло и создают базу для оштукатуривания и облицовки декоративными панелями.
В первом случае укладка происходит на лаги, уложенные на расстоянии около 60 см друг от друга. Для выравнивания плиты укладываются на любое основание. Поверх них монтируется чистовая отделка пола.
Без использования химикатов эти материалы не смешиваются, прежде всего из-за сахаров, содержащихся в древесине. Важно, что среди используемых присадок нет опасных для человека или окружающей среды веществ, так что ЦСП можно с уверенностью назвать экологически чистым.
При этом линейные размеры изделия и его толщина не изменятся настолько, чтобы это составляло проблему.
Работа с ними по силам бригаде из 3-4 человек.
Чаще всего в продаже встречается ЦПС, фасованная в мешки по 25 или 50 кг, но также существует ЦПС, которую поставляют непосредственно с цементных заводов в самосвалах. Последняя чаще всего используется для выкладывания тротуаров и дорог плиткой.
За счет этого замощенная площадка простоит больше времени.
СтройПлатформа на 100% «белая» организация, которая может предоставить полный перечень закрывающих документов точно в срок.
8-2.0 кг/м2
Целью нашего исследования было сравнение хромогенной среды chromID CPS Elite (bioMérieux) с обычной первичной культуральной средой для оценки образцов мочи. Остаточные образцы мочи ( n = 200) инокулировали в обычные среды и в агар chromID CPS Elite (chromID). Время идентификации и использованные расходные материалы были задокументированы для обоих методов. Клинически значимый патоген (ы) был выделен из 51 культуры с использованием обычных сред, из которых Escherichia coli были наиболее часто выздоровевшими организмами ( n = 22).Степень точного совпадения уропатогенов между традиционной и хромогенной средами составила 82%, в то время как общее категориальное совпадение составило 83,5%. Временной интервал между посевом и окончательной идентификацией микроорганизмов был уменьшен с помощью хромированного агара по сравнению с традиционной средой для E. coli (в среднем 24,4 часа). против 27,1 ч, P <0,001). Используя chromID, клинически значимые культуры требовали меньше времени на обработку одной культуры (в среднем 1 мин и 2 с [1:02 мин]) по сравнению с обычными средами (в среднем 1:31 мин).
Кроме того, для использования chromID потребовалось меньше расходных материалов (2,4 против 3,3 палочек и тампонов) и быстрые биохимические тесты (1,0 против 1,9) по сравнению с обычными средами. Примечательно, что тестирование на чувствительность к противомикробным препаратам продемонстрировало хорошее общее согласие (97,4%) между chromID и обычными средами для всех протестированных антибиотиков. chromID CPS Elite обеспечивает точную идентификацию уропатогенов, снижает расход расходных материалов и может ускорить идентификацию E. coli в клинических образцах.
Таким образом, существует потребность в точных методах, позволяющих сэкономить время и снизить рабочую нагрузку. Кроме того, все большее внимание уделяется ускорению получения результатов посева от пациентов с инфекцией; минимизация окна диагностической неопределенности имеет важное значение для оптимизации противомикробной терапии и улучшения результатов лечения пациентов (4).
И стрептококками группы B, вносящими значительный вклад в стрептококки группы B (GBS). часть эпидемиологии ИМП (16). Поскольку этиология большинства ИМП ограничивается несколькими микроорганизмами, культивирование уропатогенов можно использовать с использованием хромогенного агара, что может минимизировать время обработки и необходимые расходные материалы.В нескольких исследованиях оценивали коммерчески доступные хромогенные агары для идентификации распространенных уропатогенов (17, –20). Недавно выпущенный в продажу хромогенный агар, агар chromID CPS Elite (chromID) (bioMérieux, Дарем, Северная Каролина), облегчает выделение и идентификацию нескольких распространенных возбудителей ИМП по характеристикам их колоний. Основным преимуществом этой среды является способность непосредственно идентифицировать E. coli . В сочетании с окрашиванием по Граму среда chromID также позволяет предположительно идентифицировать Enterococcus spp., некоторые представители группы Enterobacteriaceae и представители группы Proteeae ( Proteus , Providencia и Morganella ).
Для этих организмов окончательная идентификация требует биохимического тестирования или анализа MALDI-TOF MS. Целью нашего исследования было сравнить эффективность chromID с использованием обычных сред для первичной культивирования образцов мочи. Для каждого типа среды оценивалась точность обнаружения уропатогенов, время работы, использование расходных материалов и время, необходимое для идентификации.Кроме того, была оценена точность теста на чувствительность к противомикробным препаратам, проведенного непосредственно с хромогенного агара, и проведено сравнение со стандартными средами.
Луи, Миссури) в рамках рутинной клинической помощи были случайным образом выбраны для включения в это исследование. Двадцать образцов в неделю оценивали в течение 10 недель. Для включения в исследование образцы должны были быть обработаны в течение 24 часов после сбора и отправлены в транспортные пробирки BD с серым верхом для культивирования мочи. Были собраны основные демографические данные субъектов, включая пол, возраст, больничное отделение и статус стационарного пациента.
При необходимости для анализа противоречий регистрировались размеры зон. AST и интерпретация результатов выполнялись в соответствии с рекомендациями Института клинических и лабораторных стандартов (CLSI) (21, 22). Все препараты оценивались на соответствие категории, и любые ошибки классифицировались.
Согласие AST было проанализировано по соглашению категорий, как описано выше.
coli как наиболее часто выздоравливающий организм ( n = 22). Члены групп Enterobacteriaceae и Proteeae представляли 11 и 2 особи соответственно. Грамположительные организмы, выделенные в значительных количествах из обычных сред, включали Enterococcus spp. ( n = 6) и Staphylococcus spp. ( п = 2). Смешанные инфекции были выявлены в семи значимых культурах. Из 51 клинически значимой культуры chromID классифицировал 45 как значимые (88.2% положительное категориальное согласие) (). При рассмотрении исключительно уропатогенов степень точного соответствия между обычными и хромогенными средами составила 82%, а общее категориальное согласие составило 83,5%. Хотя Vitek MS не был одобрен Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США (FDA) для тестирования непосредственно с хромогенной среды, результаты тестирования MALDI-TOF MS с этой средой совпадают с результатами тестирования с использованием крови или агара МакКонки.
coli ( n = 2) и коагулазонегативные стафилококки (ЦНС; n = 1). В одном образце со смешанной инфекцией Proteus mirabilis был выделен из chromID, но не из обычных сред. Примечательно, что GBS был выделен из пяти образцов, классифицированных как незначительные или загрязненные на обычных средах, но не был выделен ни в каком количестве из соответствующей культуры на хромогенных средах.
Большинство этих различий было связано с культурами чистой E. coli , у которых было значительно меньшее время практической работы (в среднем 0:20 по сравнению с 1:24 м: сс), использование расходных материалов (среднее 0,33 против 3,33) и быстрые биохимические анализы (среднее 0,22 против 2,22) и необходимость идентификации MALDI-TOF MS (среднее 0,11 против 1,11) по сравнению с обычными средами. Не было обнаружено значительных различий в необходимости окрашивания по Граму или пересева для любой категории посева мочи ().
029
99
12
59
01
30
Важно отметить, что предварительная идентификация на уровне рода может быть получена только для одной значимой культуры, помещенной в обычную среду, по сравнению с 17 культурами из хромогенной среды (данные не показаны). Сравнение времени, необходимого для окончательной идентификации уропатогенов в клинически значимых культурах, не обнаружило существенной разницы между chromID и традиционной средой (26,6 против 27,2 ч, P = 0,550). Сравнение подмножества клинически значимых культур, в которых выросли чистые E.coli показал значительное сокращение времени до окончательной идентификации E. coli с хромогенными средами по сравнению с обычными средами (24,4 ч против 27,1 ч, P = <0,0001) (). Однако не было замечено никакой разницы во времени до окончательного отчета о результатах тестирования на чувствительность к противомикробным препаратам для всех культур, включая культуры, в которых E. coli было выделено в чистой культуре (). Изоляты, выделенные в количествах, превышающих пороговое значение для значимости, за исключением CNS, Lactobacillus spp.
, и GBS, были подвергнуты АСТ. Результаты установки AST непосредственно из хромогенных сред сравнивали с результатами, полученными с использованием стандартных процедур, в которых среды AST были засеяны из обычного агара. Из 33 протестированных изолятов Enterobacteriaceae было обнаружено шесть незначительных ошибок, четыре основных ошибки и никаких очень серьезных ошибок, когда AST был установлен непосредственно из хромогенной среды (). Пять ошибок произошли на двух изолятах, а остальные пять — на пяти разных изолятах. Для Enterococcus spp.( n = 6), только четыре незначительные ошибки произошли при AST с chromID, состоящие из одной ошибки для ванкомицина, ципрофлоксацина и доксициклина для одного и того же изолята и одной ошибки для линезолида на другом изоляте. Не было ошибок в AST для Staphylococcus aureus ( n = 1) или Pseudomonas aeruginosa ( n = 2).
2
2
1
Согласование категорий для AST для всех протестированных препаратов и изолятов было 100% между полупрозрачной и непрозрачной средами (данные не показаны).